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肿瘤多样性和通用癌症任务之间的权衡。
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2019-11-28 , DOI: 10.1038/s41467-019-13195-1 Jean Hausser 1 , Pablo Szekely 1 , Noam Bar 1 , Anat Zimmer 1 , Hila Sheftel 1 , Carlos Caldas 2, 3 , Uri Alon 1
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最近的进展使得我们能够使用强大的方法将肿瘤分为预后组和治疗组。然而，我们仍然缺少一个通用的理论框架来理解肿瘤基因表达和突变的巨大多样性。在这里，我们提出了一个基于多任务进化理论的框架，利用肿瘤需要执行有助于其适应的多个任务这一事实。我们发现任务之间的权衡将肿瘤基因表达限制在一个由多面体包围的连续体中，该多面体的顶点是基因表达谱，每个多面体专门从事一项任务。我们发现跨组织类型的五种普遍癌症任务：细胞分裂、生物量和能量、脂肪生成、免疫相互作用和侵袭以及组织重塑。专门从事某项任务的肿瘤对干扰该任务的药物敏感。驱动突变而非乘客突变将基因表达调整为特定任务的专业化。这种方法可以将其他类型的分子数据整合到基于进化理论的肿瘤多样性框架中。
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