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通过对接和分子模拟研究适体与palytoxin的结合机理。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-10-29 , DOI: 10.1038/s41598-019-52066-z Bo Hu 1, 2 , Rong Zhou 1, 2 , Zhengang Li 1, 2 , Shengqun Ouyang 1 , Zhen Li 1 , Wei Hu 3 , Lianghua Wang 1 , Binghua Jiao 1, 2
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-10-29 , DOI: 10.1038/s41598-019-52066-z Bo Hu 1, 2 , Rong Zhou 1, 2 , Zhengang Li 1, 2 , Shengqun Ouyang 1 , Zhen Li 1 , Wei Hu 3 , Lianghua Wang 1 , Binghua Jiao 1, 2
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本文为适体与小分子的分子结构分析及相互作用机理提供了可行的模型。在这项研究中，分别进行了ssDNA适体（P-18S2）和靶标（Palytoxin，PTX）的建模和动态仿真。然后，预测了DNA与PTX之间的复杂结构，对接结果表明，PTX可以通过强大的氢键和静电相互作用在DNA模型的凹槽顶部稳定结合。因此，我们通过仿真截断和优化了P-18S2。同时，我们还通过实验证实了仿真结果的可靠性。通过实验和计算结果，该研究为P-18S2与PTX的高亲和力和特异性结合提供了更合理的解释，
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更新日期：2019-10-29
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