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RNA 结合蛋白 IMP 家族的 RNA 选择性的结构基础。
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2019-09-30 , DOI: 10.1038/s41467-019-12193-7 Jeetayu Biswas 1 , Vivek L Patel 2 , Varun Bhaskar 3 , Jeffrey A Chao 3 , Robert H Singer 1, 4 , Carolina Eliscovich 1, 5
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IGF2 mRNA 结合蛋白(ZBP1/IMP1、IMP2、IMP3)是高度保守的 RNA 稳定性、定位和翻译的转录后调节因子。它们在细胞迁移、神经发育、新陈代谢和癌细胞存活中发挥着重要作用。单个 IMP 蛋白的敲除表型表明,每个家族成员都调节着独特的 RNA 库,但目前尚缺乏证据和潜在机制。在这里,我们结合指数富集配体的系统进化(SELEX)和核磁共振波谱来证明两个关系最远的 IMP(ZBP1 和 IMP2)的主要 RNA 结合域结合不同的共有序列并调节与其敲除一致的靶标表型和在疾病中的作用。我们发现每个 IMP 的靶向特异性是由其可变环中的少数氨基酸决定的。由于 KH 结构域旁系同源物之间的可变环通常不同,我们假设这是转录组进化特异性和调节的一般机制。
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