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核孔作为定量超分辨率显微镜的通用参考标准。
Nature Methods ( IF 36.1 ) Pub Date : 2019-09-27 , DOI: 10.1038/s41592-019-0574-9 Jervis Vermal Thevathasan 1, 2 , Maurice Kahnwald 1 , Konstanty Cieśliński 1 , Philipp Hoess 1, 2 , Sudheer Kumar Peneti 1, 3 , Manuel Reitberger 1, 4 , Daniel Heid 1, 5 , Krishna Chaitanya Kasuba 1, 6 , Sarah Janice Hoerner 1, 7 , Yiming Li 1 , Yu-Le Wu 1, 2 , Markus Mund 1, 8 , Ulf Matti 1 , Pedro Matos Pereira 9 , Ricardo Henriques 9 , Bianca Nijmeijer 1 , Moritz Kueblbeck 1 , Vilma Jimenez Sabinina 1 , Jan Ellenberg 1 , Jonas Ries 1
Nature Methods ( IF 36.1 ) Pub Date : 2019-09-27 , DOI: 10.1038/s41592-019-0574-9 Jervis Vermal Thevathasan 1, 2 , Maurice Kahnwald 1 , Konstanty Cieśliński 1 , Philipp Hoess 1, 2 , Sudheer Kumar Peneti 1, 3 , Manuel Reitberger 1, 4 , Daniel Heid 1, 5 , Krishna Chaitanya Kasuba 1, 6 , Sarah Janice Hoerner 1, 7 , Yiming Li 1 , Yu-Le Wu 1, 2 , Markus Mund 1, 8 , Ulf Matti 1 , Pedro Matos Pereira 9 , Ricardo Henriques 9 , Bianca Nijmeijer 1 , Moritz Kueblbeck 1 , Vilma Jimenez Sabinina 1 , Jan Ellenberg 1 , Jonas Ries 1
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定量荧光和超分辨率显微镜通常受到数据质量不足或伪影的限制。在这种情况下,拥有生物学相关的对照样本来衡量和优化显微镜、标签和成像条件的质量至关重要。在这里,我们利用核孔复合物中蛋白质的刻板排列作为原位参考结构来表征各种显微镜模式的性能。我们创建了四种基因组编辑细胞系,其中用 mEGFP、SNAP-tag、HaloTag 或光转换荧光蛋白 mMaple 内源标记核孔蛋白 Nup96。我们展示了它们的用途:(1) 作为校准和质量控制的三维分辨率标准品,(2) 量化绝对标记效率,以及 (3) 作为分子计数的精确参考标准品。这些细胞系将使更广泛的社区能够评估其显微镜和标签的质量,并进行定量、绝对测量。
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更新日期:2019-09-28
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