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加性和杂合(不利)GWAS模型揭示了与巴西细螺旋体玉米杂交种的基因型变异有关的候选基因。
PLOS ONE ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-09-19 , DOI: 10.1371/journal.pone.0222788
Miriam Suzane Vidotti 1 , Danilo Hottis Lyra 2 , Júlia Silva Morosini 1 , Ítalo Stefanine Correia Granato 3 , Maria Carolina Quecine 1 , João Lúcio de Azevedo 1 , Roberto Fritsche-Neto 1
PLOS ONE ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-09-19 , DOI: 10.1371/journal.pone.0222788
Miriam Suzane Vidotti 1 , Danilo Hottis Lyra 2 , Júlia Silva Morosini 1 , Ítalo Stefanine Correia Granato 3 , Maria Carolina Quecine 1 , João Lúcio de Azevedo 1 , Roberto Fritsche-Neto 1
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玉米基因型可以显示出不同的抗巴西固氮螺菌接种反应,而一个有趣的问题是植物的哪些基因参与了这些促进植物生长的细菌(PGPB)的识别和生长促进。我们进行了全基因组关联研究(GWAS),使用加性和杂合(dis)优势模型来查找在氮(N)胁迫和N胁迫以及巴西拟南芥(A. brasilense)下根和芽性状的候选基因。总共52,215个单核苷酸多态性(SNP)标记用于GWAS分析。对于六个具有显着接种效果的根部性状,GWAS分析显示,N胁迫加巴西柔菇处理的25个重要SNP,其中只有两个与仅针对N胁迫的22个重叠。多数是通过杂合(dis)优势模型发现的,并且与专有基因本体术语更相关。有趣的是,在玉米-A的重要SNP周围的候选基因。brasilense协会参与了先前针对植物中PGPB所描述的不同功能(例如植物防御系统的信号传导途径和植物激素的生物合成)。我们的发现是理解玉米杂交种与巴西柔毛霉的关联中的遗传变异的基准,并揭示了通过这种关联进一步增强玉米的潜力。植物防御系统和植物激素生物合成的信号通路)。我们的发现是理解玉米杂交种与巴西柔毛霉的关联中的遗传变异的基准,并揭示了通过这种关联进一步增强玉米的潜力。植物防御系统和植物激素生物合成的信号通路)。我们的发现是理解玉米杂交种与巴西柔毛霉的关联中的遗传变异的基准,并揭示了通过这种关联进一步增强玉米的潜力。
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更新日期:2019-09-20
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