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mRNA 结构决定了假尿苷合酶 1 的修饰。
Nature Chemical Biology ( IF 12.9 ) Pub Date : 2019-09-02 , DOI: 10.1038/s41589-019-0353-z Thomas M Carlile 1, 2 , Nicole M Martinez 3 , Cassandra Schaening 1 , Amanda Su 1, 4 , Tristan A Bell 1 , Boris Zinshteyn 1, 5 , Wendy V Gilbert 3
Nature Chemical Biology ( IF 12.9 ) Pub Date : 2019-09-02 , DOI: 10.1038/s41589-019-0353-z Thomas M Carlile 1, 2 , Nicole M Martinez 3 , Cassandra Schaening 1 , Amanda Su 1, 4 , Tristan A Bell 1 , Boris Zinshteyn 1, 5 , Wendy V Gilbert 3
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伪尿苷 (Ψ) 是一种转录后 RNA 修饰,可改变影响基因表达的 RNA-RNA 和 RNA-蛋白质相互作用。信使 RNA 假尿苷化最近被发现是一种普遍且保守的现象,但负责 mRNA 内特定序列的选择性、受调节的假尿苷化的机制尚不清楚。在这里,我们揭示了五种假尿苷合酶的 mRNA 靶标,并通过在体外开发假尿苷化的高通量动力学分析,探讨了主要 mRNA 假尿苷化酶 Pus1 识别 mRNA 靶标的决定因素。结合计算预测和合理的突变分析揭示了一个 RNA 结构基序,它对于 mRNA 假尿苷化是必要和充分的。应用这种结构背景信息预测了数百个在体内被假尿苷化的额外 mRNA 靶标。这些结果证明了保守假尿苷合酶对 mRNA 靶标识别的结构依赖性模式,并暗示 RNA 结构的调节是调节 mRNA 假尿苷化的可能机制。
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更新日期:2019-09-03
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