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使用微型热泳研究钾诱导的G-四链体DNA折叠过程。
Biochemistry ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-09-09 , DOI: 10.1021/acs.biochem.9b00447 Ming-Li Zhang 1 , Ya-Peng Xu 1 , Arvind Kumar 1 , Yu Zhang 1 , Wen-Qiang Wu 1
Biochemistry ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-09-09 , DOI: 10.1021/acs.biochem.9b00447 Ming-Li Zhang 1 , Ya-Peng Xu 1 , Arvind Kumar 1 , Yu Zhang 1 , Wen-Qiang Wu 1
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鸟嘌呤（G）四链体（G4s）当通过阳离子（通常为K +或Na +）的结合而稳定时，可以由富含G的序列形成，并在复制，重组，转录和端粒维持中起重要作用。了解G4折叠过程对于确定其细胞功能至关重要。但是，人们对G4–K +的相互作用和折叠途径仍然知之甚少。以人端粒G4（hTG4）为例，可以清楚地区分和精确拟合对应于与hTG4结合的两个K +阳离子的两个结合状态。G4–K +期间的基本绑定参数通过利用微尺度热泳（MST）来测量和计算相互作用，该技术同时监控电荷和大小的变化。已建议在G4折叠和展开过程中将G-发夹和G-三链体作为中间体。我们使用MST进一步分析了10种可能的折叠中间体的平衡解离常数。因此，提出了能量上有利的折叠/展开路径。该结果不仅可以为G4–K +相互作用和G4折叠途径提供新的线索，而且还可以为实验研究DNA与离子相互作用提供一个实例。
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更新日期：2019-09-10
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