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Frequencies of clinically important CYP2C19 and CYP2D6 alleles are graded across Europe.
European Journal of Human Genetics ( IF 3.7 ) Pub Date : 2019-07-29 , DOI: 10.1038/s41431-019-0480-8 Jelena Petrović 1, 2 , Vesna Pešić 2 , Volker M Lauschke 1
European Journal of Human Genetics ( IF 3.7 ) Pub Date : 2019-07-29 , DOI: 10.1038/s41431-019-0480-8 Jelena Petrović 1, 2 , Vesna Pešić 2 , Volker M Lauschke 1
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CYP2C19 and CYP2D6 are important drug-metabolizing enzymes that are involved in the metabolism of around 30% of all medications. Importantly, the corresponding genes are highly polymorphic and these genetic differences contribute to interindividual and interethnic differences in drug pharmacokinetics, response, and toxicity. In this study we systematically analyzed the frequency distribution of clinically relevant CYP2C19 and CYP2D6 alleles across Europe based on data from 82,791 healthy individuals extracted from 79 original publications and, for the first time, provide allele confidence intervals for the general population. We found that frequencies of CYP2D6 gene duplications showed a clear South-East to North-West gradient ranging from <1% in Sweden and Denmark to 6% in Greece and Turkey. In contrast, an inverse distribution was observed for the loss-of-function alleles CYP2D6*4 and CYP2D6*5. Similarly, frequencies of the inactive CYP2C19*2 allele were graded from North-West to South-East Europe. In important contrast to previous work we found that the increased activity allele CYP2C19*17 was most prevalent in Central Europe (25-33%) with lower prevalence in Mediterranean-South Europeans (11-24%). In summary, we provide a detailed European map of common CYP2C19 and CYP2D6 variants and find that frequencies of the most clinically relevant alleles are geographically graded reflective of Europe's migratory history. These findings emphasize the importance of generating pharmacogenomic data sets with high spatial resolution to improve precision public health across Europe.
中文翻译：
临床上重要的 CYP2C19 和 CYP2D6 等位基因的频率在整个欧洲分级。
CYP2C19 和 CYP2D6 是重要的药物代谢酶，参与约 30% 的药物代谢。重要的是，相应的基因是高度多态的，这些遗传差异导致药物药代动力学、反应和毒性的个体间和种族间差异。在这项研究中，我们基于从 79 份原始出版物中提取的 82,791 名健康个体的数据，系统地分析了欧洲临床相关 CYP2C19 和 CYP2D6 等位基因的频率分布，并首次提供了一般人群的等位基因置信区间。我们发现 CYP2D6 基因重复的频率显示出明显的东南到西北梯度，范围从瑞典和丹麦的 <1% 到希腊和土耳其的 6%。相比之下，观察到功能丧失等位基因 CYP2D6*4 和 CYP2D6*5 呈反向分布。类似地，失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西北欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西北欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最具临床相关性的等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集的重要性，以改善整个欧洲的精准公共卫生。我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最具临床相关性的等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。
更新日期：2019-07-29
中文翻译：
临床上重要的 CYP2C19 和 CYP2D6 等位基因的频率在整个欧洲分级。
CYP2C19 和 CYP2D6 是重要的药物代谢酶，参与约 30% 的药物代谢。重要的是，相应的基因是高度多态的，这些遗传差异导致药物药代动力学、反应和毒性的个体间和种族间差异。在这项研究中，我们基于从 79 份原始出版物中提取的 82,791 名健康个体的数据，系统地分析了欧洲临床相关 CYP2C19 和 CYP2D6 等位基因的频率分布，并首次提供了一般人群的等位基因置信区间。我们发现 CYP2D6 基因重复的频率显示出明显的东南到西北梯度，范围从瑞典和丹麦的 <1% 到希腊和土耳其的 6%。相比之下，观察到功能丧失等位基因 CYP2D6*4 和 CYP2D6*5 呈反向分布。类似地，失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西北欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。失活的 CYP2C19*2 等位基因的频率从西北欧到东南欧分级。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。与之前的工作形成鲜明对比的是，我们发现活性增加的等位基因 CYP2C19*17 在中欧 (25-33%) 中最为普遍，而在地中海-南欧人中的流行率较低 (11-24%)。总之，我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最临床相关等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最具临床相关性的等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集的重要性，以改善整个欧洲的精准公共卫生。我们提供了常见 CYP2C19 和 CYP2D6 变体的详细欧洲图谱，并发现最具临床相关性的等位基因的频率在地理上分级反映了欧洲的迁徙历史。这些发现强调了生成具有高空间分辨率的药物基因组数据集以改善整个欧洲的精准公共卫生的重要性。
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