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水稻对镉胁迫响应的转录组分析。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-07-15 , DOI: 10.1038/s41598-019-46684-w
Lijuan Sun 1, 2, 3, 4, 5 , Jun Wang 1, 6 , Ke Song 1, 2, 3, 4, 5 , Yafei Sun 1, 2, 3, 4, 5 , Qin Qin 1, 2, 3, 4, 5 , Yong Xue 1, 2, 3, 4, 5
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更新日期:2019-07-15
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-07-15 , DOI: 10.1038/s41598-019-46684-w
Lijuan Sun 1, 2, 3, 4, 5 , Jun Wang 1, 6 , Ke Song 1, 2, 3, 4, 5 , Yafei Sun 1, 2, 3, 4, 5 , Qin Qin 1, 2, 3, 4, 5 , Yong Xue 1, 2, 3, 4, 5
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镉(Cd)对活生物体有剧毒。这项研究旨在阐明在镉胁迫下水稻芽中基因表达的调控。在水培条件下,将水稻植株暴露于0、50、75、100μmol/ L CdCl 2中7 d。通过转录组测序技术检查了水稻芽中的转录变化。在75μmol/ L CdCl 2暴露下,大米中总共检测到2197个DEG(987个上调和1210个下调)。。GO和KEGG富集分析表明,编码植物生长素应答蛋白IAA和过氧化物酶的基因被上调,而编码信号转导的蛋白质(包括TIFY家族,ERF和bZIP)的基因被下调。还确定了丰富的ROS相关术语并将其归类为差异显着表达的GO术语,包括氧化还原酶活性,催化活性,氧化还原过程,从而证实了Cd的氧化应激增强。能量代谢途径中编码光系统I反应中心亚基和管腔位置光合NDH亚基的基因上调,提示镉胁迫对光合作用产生了干扰。我们的结果提高了对Cd胁迫下水稻芽的复杂分子响应机制的理解。
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