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用于组织病理学的类似图像搜索:SMILY
npj Digital Medicine ( IF 12.4 ) Pub Date : 2019-06-21 , DOI: 10.1038/s41746-019-0131-z
Narayan Hegde , Jason D. Hipp , Yun Liu , Michael Emmert-Buck , Emily Reif , Daniel Smilkov , Michael Terry , Carrie J. Cai , Mahul B. Amin , Craig H. Mermel , Phil Q. Nelson , Lily H. Peng , Greg S. Corrado , Martin C. Stumpe

大型机构和公共组织病理学图像数据集的可用性越来越高,这使得能够搜索这些数据集以进行诊断,研究和教育。尽管这些数据集通常具有相关的元数据,例如诊断或临床注释,但即使精心挑选的数据集也很少包含每个图像上感兴趣区域的位置的注释。由于病理图像非常大(每个维度最多100,000个像素),可能需要对每个图像进行进一步的费力视觉搜索才能找到感兴趣的特征。在本文中,我们为组织病理学图像引入了一种基于深度学习的反向图像搜索工具:类似您的医学图像(SMILY)。我们通过两种方式评估了SMILY检索搜索结果的能力:使用病理学家提供的注释,并通过前瞻性研究,病理学家评估了SMILY搜索结果的质量。作为第二次评估的阴性对照,病理学家对SMILY是随机检索还是随机检索了搜索结果视而不见。在两种类型的评估中,与原始查询相比,SMILY都能检索到具有相似组织学特征,器官部位和前列腺癌Gleason评分的搜索结果。SMILY可能是病理学家武器库中有用的通用工具,可提高搜索大型组织病理学图像档案的效率,而无需为每个应用程序开发和实施特定工具。在两种类型的评估中,与原始查询相比,SMILY都能检索到具有相似组织学特征,器官部位和前列腺癌Gleason评分的搜索结果。SMILY可能是病理学家武器库中有用的通用工具,可提高搜索大型组织病理学图像档案的效率,而无需为每个应用程序开发和实施特定工具。与原始查询相比,在这两种类型的评估中,SMILY都能检索到具有相似的组织学特征,器官部位和前列腺癌Gleason评分的搜索结果。SMILY可能是病理学家武器库中有用的通用工具,可提高搜索大型组织病理学图像档案的效率,而无需为每个应用程序开发和实施特定工具。





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更新日期:2019-06-21
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