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具有短结合臂的新型小RNA切割脱氧核酶。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-06-03 , DOI: 10.1038/s41598-019-44750-x
Yueyao Wang 1 , Jintao Yang 2 , Xin Yuan 3 , Jin Cao 2 , Jiacui Xu 4 , John C Chaput 5 , Zhe Li 2 , Hanyang Yu 2
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能够催化序列特异性RNA裂解的脱氧核酶已经在生物技术,DNA计算和环境传感中得到了广泛的应用。其中,脱氧核酶8-17是最常见的能够催化RNA裂解的小DNA基序。但是,具有相似催化基序的其他DNA分子存在的程度仍然难以捉摸。在这里,我们报道了一种称为10–12opt的新型RNA裂解脱氧核酶,其功能相同,催化基序小,结合臂短。该脱氧核酶包含一个14个核苷酸的催化核心,该核优先催化UN双核苷酸连接处的RNA裂解(k obs  = 0.9 h -1(用于UU切割)。令人惊讶地,左结合臂仅包含三个核苷酸,并与RNA底物形成两个标准碱基对。突变分析表明,裂解位点下游的核糖鸟苷残基3-核苷酸必须不形成规范的碱基配对才能实现最佳催化作用,并且该核碱基可能与其羰基O6原子一起参与催化作用。此外,我们证明脱氧核酶10-12opt可用于切割某些微RNA序列,而这些序列不会被8-17优先切割。总之,这些结果表明,这种新颖的裂解RNA的脱氧核酶比8-17具有独特的催化结构,并且序列空间可能包含可在特定位点裂解RNA的DNA分子的其他例子。





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更新日期:2019-06-03
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