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静电对细菌视紫红质和卤代视紫红质中的异构化的影响。
The Journal of Physical Chemistry B ( IF 2.8 ) Pub Date : 2019-05-31 , DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b01837
C Punwong 1 , S Hannongbua 2 , T J Martínez 3, 4
The Journal of Physical Chemistry B ( IF 2.8 ) Pub Date : 2019-05-31 , DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b01837
C Punwong 1 , S Hannongbua 2 , T J Martínez 3, 4
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细菌视紫红质(bR)和盐细菌视紫红质(hR)都是膜蛋白,可在盐细菌中跨细胞膜转运离子。它们的离子转运功能是由视网膜质子化席夫碱(RPSB)生色团的光活化异构化触发的。尽管bR和hR的结构相似,但它们的RPSB异构化速率和量子产率却大不相同(bR比hR更快,更高效)。以前使用QM / MM使用从头算多产卵(AIMS)在bR和hR中进行光异构化的模拟已成功重现了实验观察到的量子产率和异构化速率的顺序,但这些差异的根源仍然难以捉摸。在这里,我们研究了静电相互作用在RPSB周围蛋白质袋中的作用。我们通过将bR / hR中的复合抗衡离子的电荷修饰为比天然状态更多/更少的负电荷来探究蛋白质静电的影响。我们发现这种修饰导致hR中的bR样行为,反之亦然。这证明了静电相互作用在控制RPSB光异构化结果中的关键作用。
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更新日期:2019-05-31

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