<br>癌细胞系代谢的景观。,Nature Medicine

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癌细胞系代谢的景观。
Nature Medicine ( IF 58.7 ) Pub Date : 2019-05-08 , DOI: 10.1038/s41591-019-0404-8
Haoxin Li _{1,

2} , Shaoyang Ning ₃ , Mahmoud Ghandi ₁ , Gregory V Kryukov ₁ , Shuba Gopal ₁ , Amy Deik ₁ , Amanda Souza ₁ , Kerry Pierce ₁ , Paula Keskula ₁ , Desiree Hernandez ₁ , Julie Ann ₄ , Dojna Shkoza ₄ , Verena Apfel ₅ , Yilong Zou ₁ , Francisca Vazquez ₁ , Jordi Barretina ₄ , Raymond A Pagliarini ₄ , Giorgio G Galli ₅ , David E Root ₁ , William C Hahn _{1,

2} , Aviad Tsherniak ₁ , Marios Giannakis _{1,

2} , Stuart L Schreiber _{1,

6} , Clary B Clish ₁ , Levi A Garraway _{1,

2} , William R Sellers _{1,

2}

Affiliation

尽管在识别可能揭示药物脆弱性的癌症代谢改变方面付出了巨大努力，但与功能基因组特征和相关依赖性相关的代谢的系统表征仍然不常见。为了进一步了解癌症的代谢多样性，我们使用液相色谱-质谱法 (LC-MS) 分析了癌细胞系百科全书 (CCLE) 中 20 多种癌症类型的 928 个细胞系中的 225 种代谢物。该资源能够进行公正的关联分析，将癌症代谢组与遗传改变、表观遗传特征和基因依赖性联系起来。此外，通过筛选条形码细胞系，我们证明异常的 ASNS 高甲基化使胃癌和肝癌亚群对天冬酰胺酶治疗敏感。最后，我们的分析揭示了模型癌细胞系中犬尿氨酸（一种免疫抑制代谢物）的独特合成和分泌模式。总之，这些发现和相关方法提供了全面的资源，将有助于阐明癌症代谢的概况。

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更新日期：2019-05-16

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