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DNAH11 variants and its association with congenital heart disease and heterotaxy syndrome.
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-04-30 , DOI: 10.1038/s41598-019-43109-6 Sida Liu 1 , Weicheng Chen 1 , Yongkun Zhan 1 , Shuolin Li 1 , Xiaojing Ma 1, 2 , Duan Ma 2, 3 , Wei Sheng 1, 2 , Guoying Huang 1, 2
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-04-30 , DOI: 10.1038/s41598-019-43109-6 Sida Liu 1 , Weicheng Chen 1 , Yongkun Zhan 1 , Shuolin Li 1 , Xiaojing Ma 1, 2 , Duan Ma 2, 3 , Wei Sheng 1, 2 , Guoying Huang 1, 2
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Congenital heart diseases (CHDs) are the most common types of birth defects, affecting approximately 1% of live births and remaining the leading cause of mortality. CHD patients often show a higher incidence of heterotaxy syndrome. However, the exact aetiology of CHD and heterotaxy syndrome remains unclear. In this study, targeted sequencing and Sanger sequencing were performed to analyze the exonic regions of 37 primary ciliary dysfunction (PCD)- related candidate genes in 42 CHD patients with heterotaxy syndrome. Variants affecting protein-coding regions were filtered according to databases of known variants and predicted in silico using functional prediction program. Thirty-four potential disease-causing heterozygous variants in 11 genes were identified in the 19 CHD patients with heterotaxy syndrome (45.2%, 19/42). The DNAH11 gene showed the highest mutation rate (16.7%; 14 of 84 alleles) among the CHD patients with heterotaxy. Fisher's exact test revealed a significant association of DNAH11 variants with CHD and heterotaxy (P = 0.0001). In families, six different compound heterozygous variants of DNAH11 were validated in family 1-5031 (p.W802X/p.M282I), family 2-5045 (p.T3460K/p.G4425S), family 3-5065 (p.G447R/p.L1157R), family 4-5130 (p.I2262T/p.D3800H), family 5-5707 (p.S1823fs/p.F2759L/p.R4395X) and family 6-5062 (p.D3610V/p.I243V). These findings suggest that the DNAH11 variants are significantly associated with CHD and heterotaxy syndrome and that compound heterozygous DNAH11 variants may be the common genetic cause of the development of familial CHD and heterotaxy syndrome.
中文翻译：
DNAH11变体及其与先天性心脏病和异型症候群的关系。
先天性心脏病（CHD）是最常见的先天性缺陷，影响约1％的活产，仍然是导致死亡的主要原因。冠心病患者通常显示出更高的异位症候群发病率。然而，冠心病和异位症候群的确切病因仍不清楚。在这项研究中，进行了靶向测序和Sanger测序，以分析42例患有异位症的CHD患者中37个原发性睫状功能障碍（PCD）相关候选基因的外显子区域。根据已知变体的数据库过滤影响蛋白质编码区的变体，并使用功能预测程序在计算机上进行预测。在19位患有异位症候群的冠心病患者中，鉴定出11个基因中的34种潜在致病杂合子（45.2％，19/42）。在患有异型的冠心病患者中，DNAH11基因显示出最高的突变率（16.7％； 84个等位基因中的14个）。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），系列4-5130（p.I2262T / p.D3800H），系列5-5707（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和系列6-5062（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。患有异位症的冠心病患者中84个等位基因中的14个。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），系列4-5130（p.I2262T / p.D3800H），系列5-5707（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和系列6-5062（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。患有异位症的冠心病患者中84个等位基因中的14个。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。
更新日期：2019-04-30
中文翻译：
DNAH11变体及其与先天性心脏病和异型症候群的关系。
先天性心脏病（CHD）是最常见的先天性缺陷，影响约1％的活产，仍然是导致死亡的主要原因。冠心病患者通常显示出更高的异位症候群发病率。然而，冠心病和异位症候群的确切病因仍不清楚。在这项研究中，进行了靶向测序和Sanger测序，以分析42例患有异位症的CHD患者中37个原发性睫状功能障碍（PCD）相关候选基因的外显子区域。根据已知变体的数据库过滤影响蛋白质编码区的变体，并使用功能预测程序在计算机上进行预测。在19位患有异位症候群的冠心病患者中，鉴定出11个基因中的34种潜在致病杂合子（45.2％，19/42）。在患有异型的冠心病患者中，DNAH11基因显示出最高的突变率（16.7％； 84个等位基因中的14个）。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），系列4-5130（p.I2262T / p.D3800H），系列5-5707（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和系列6-5062（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。患有异位症的冠心病患者中84个等位基因中的14个。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），系列4-5130（p.I2262T / p.D3800H），系列5-5707（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和系列6-5062（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。患有异位症的冠心病患者中84个等位基因中的14个。Fisher的精确测试表明，DNAH11变异与CHD和异源性存在显着相关性（P = 0.0001）。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。在家族中，在1-5031家族（p.W802X / p.M282I），2-5045家族（p.T3460K / p.G4425S），3-5065家族（p.G447R / p.L1157R），4-5130系列（p.I2262T / p.D3800H），5-5707系列（p.S1823fs / p.F2759L / p.R4395X）和6-5062系列（p.D3610V / p.I243V） 。这些发现表明，DNAH11变异与冠心病和异型症候群显着相关，复合杂合DNAH11变异可能是家族性冠心病和异型症候群发展的常见遗传原因。
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