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泛素通过α-溶血素纳米孔的易位中间体：对翻译后修饰检测的意义。
Nanoscale ( IF 5.8 ) Pub Date : 2019-05-09 , DOI: 10.1039/c8nr10492a Emma Letizia Bonome 1 , Fabio Cecconi 2 , Mauro Chinappi 3
Nanoscale ( IF 5.8 ) Pub Date : 2019-05-09 , DOI: 10.1039/c8nr10492a Emma Letizia Bonome 1 , Fabio Cecconi 2 , Mauro Chinappi 3
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基于纳米孔的传感器构成了对单分子蛋白质进行表征的有前途的方法，该方法原则上能够检测蛋白质和多肽链的序列，结构元件和折叠状态。在狭窄的纳米孔中，未解决的问题之一涉及展开和易位之间的耦合。在这里，我们通过全原子分子动力学模拟研究了α-溶血素纳米孔中泛素转运，α-溶血素纳米孔是用于纳米孔感测的最广泛使用的孔。我们完全表征了共易位的展开途径，发现坚固的易位中间体与二级结构元素的重排有关，这也得到了粗粒模拟的证实。一个有趣的复发模式是N末端的β-发夹堵塞了α-溶血素的收缩。泛素的这一区域是几种翻译后修饰的目标。我们提出了一种策略，该方法基于与修饰和未修饰蛋白相关的共易位解折叠信号的比较，使用α-溶血素纳米孔检测N末端的翻译后修饰。
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更新日期：2019-04-17
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