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核磁共振光谱鉴定胶质母细胞瘤肿瘤干细胞对靶向治疗无反应的代谢物生物标志物。
Journal of Proteome Research ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-04-18 , DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00801 Ingvild Comfort Hvinden 1, 2 , Henriette Engen Berg 1 , Daniel Sachse 1 , Erlend Skaga 3, 4 , Frøydis Sved Skottvoll 1, 5 , Elsa Lundanes 1 , Cecilie J Sandberg 3 , Einar O Vik-Mo 3 , Frode Rise 1 , Steven Ray Wilson 1, 5
Journal of Proteome Research ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-04-18 , DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00801 Ingvild Comfort Hvinden 1, 2 , Henriette Engen Berg 1 , Daniel Sachse 1 , Erlend Skaga 3, 4 , Frøydis Sved Skottvoll 1, 5 , Elsa Lundanes 1 , Cecilie J Sandberg 3 , Einar O Vik-Mo 3 , Frode Rise 1 , Steven Ray Wilson 1, 5
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胶质母细胞瘤是最常见和最恶性的脑肿瘤,目前的疗法只能带来适度的生存益处。一个主要障碍是我们监测肿瘤治疗效果的能力。目前的成像方式不明确,不鼓励重复活检。为了寻找治疗反应的标志物,我们使用核磁共振波谱来研究生存素抑制剂对原发性胶质母细胞瘤癌症干细胞代谢组的影响。对每个样品仅 300 万个细胞应用高分辨率 NMR 光谱(1H 共振频率:800.03 MHz),我们实现了对氨基酸、核苷和柠檬酸循环成分等的灵敏和高分辨率测定。对于在不同日期培养、制备和测量的对照样品,峰面积相对标准偏差为 15-20%。使用 COLMAR 和 HMDB 数据库对未分级裂解物进行分析,以便直接进行化合物鉴定。主成分分析显示柠檬酸盐水平在无反应细胞中明显上调,而乳酸水平在反应和无反应细胞治疗后显着降低。因此,乳酸和柠檬酸盐可能分别是药物成功吸收和对生存素抑制剂反应不佳的潜在标志物。与基于光谱的蛋白质组学相比,我们的代谢组学方法提供了替代的生物标志物候选物,强调了互补方法的好处。这些初步发现为探索脑肿瘤的体内 MR 光谱 (MRS) 奠定了基础,因为柠檬酸盐和乳酸是 MRS 可见的。总之,NMR 代谢组学是解决胶质母细胞瘤的工具。
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更新日期:2019-04-20
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