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系统发育分析的改进的参数揭示了lncRNA结构中的保守性。
Journal of Molecular Biology ( IF 4.7 ) Pub Date : 2019-03-16 , DOI: 10.1016/j.jmb.2019.03.012 Rafael C.A. Tavares , Anna Marie Pyle , Srinivas Somarowthu
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更新日期:2019-03-16
Journal of Molecular Biology ( IF 4.7 ) Pub Date : 2019-03-16 , DOI: 10.1016/j.jmb.2019.03.012 Rafael C.A. Tavares , Anna Marie Pyle , Srinivas Somarowthu
碱基配对中进化保守性的存在是RNA结构功能元件的有力证据,尽管严格鉴定结构保守性的可用工具有限。R-scape是最近开发的程序,用于从序列比对统计预测成对协变,但最初显示其在长RNA上的应用有限,特别是在真核来源的RNA上。在这里,我们显示R-scape可用于在长RNA分子(包括哺乳动物lncRNA)中更有效地分析结构保守性。
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