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Long-term molecular remission in a patient with acute myeloid leukemia harboring a new NUP98-LEDGF rearrangement.
Cancer Medicine ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-03-07 , DOI: 10.1002/cam4.2051
Maria Pilar Gallego Hernanz 1 , José Miguel Torregrosa Diaz 1 , Nathalie Sorel 2 , Arthur Bobin 1 , Elodie Dindinaud 3 , Sabrina Bouyer 3 , Deborah Desmier 1 , Françoise Brizard 3 , Xavier Leleu 1, 4 , Natacha Maillard 1 , Jean-Claude Chomel 2
Cancer Medicine ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-03-07 , DOI: 10.1002/cam4.2051
Maria Pilar Gallego Hernanz 1 , José Miguel Torregrosa Diaz 1 , Nathalie Sorel 2 , Arthur Bobin 1 , Elodie Dindinaud 3 , Sabrina Bouyer 3 , Deborah Desmier 1 , Françoise Brizard 3 , Xavier Leleu 1, 4 , Natacha Maillard 1 , Jean-Claude Chomel 2
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A large variety of molecular rearrangements of the NUP98 gene have been described in the past decades (n = 72), involving fusion partners coding for different transcription factors, chromatin modifying enzymes, as well as various cytosolic proteins. Here, we report the case of an AML-M2 patient with a variant NUP98-LEDGF/PSIP1 gene fusion (N9-L10). In this patient, three different NUP98-LEDGF fusion mRNAs were characterized due to alternative splicing in LEDGF exon 11. Targeted high-throughput sequencing revealed the presence of IDH1, SRSF2, and WT1 additional pathogenic mutations. To improve the therapeutic monitoring, quantification of NUP98-LEDGF mRNA by real-time PCR was developed. Because of poor response to conventional chemotherapy, allogeneic stem cell transplantation was performed, followed by 20 cycles of azacitidine-based preemptive treatment of relapse. More than 31 months after diagnosis, corresponding to 25 months post SCT and 4 months after the last cycle of azacytidine, the patient is in complete molecular remission (undetectable NUP98-LEDGF mRNA transcripts). This study highlights the considerable variability in breakpoint location within both NUP98 and LEDGF, associated with alternative splicing affecting LEDGF. It also emphasizes the need to fully characterize the breakpoints within the two genes and the identification of all fusion mRNAs, particularly for the development of a molecular monitoring assay. All these data seem critical for the optimal management of NUP98-LEDGF + hematological malignancies commonly associated with a poor prognosis.
中文翻译：
具有新的NUP98-LEDGF重排的急性髓细胞性白血病患者的长期分子缓解。
在过去的几十年中（n = 72）已经描述了NUP98基因的多种分子重排，涉及编码不同转录因子，染色质修饰酶以及各种胞质蛋白的融合伴侣。在这里，我们报告了具有变体NUP98-LEDGF / PSIP1基因融合（N9-L10）的AML-M2患者。在该患者中，由于LEDGF外显子11的选择性剪接，对三种不同的NUP98-LEDGF融合mRNA进行了表征。靶向的高通量测序揭示了IDH1，SRSF2和WT1其他病原性突变的存在。为了改善治疗监测，开发了通过实时PCR定量NUP98-LEDGF mRNA的方法。由于对常规化学疗法的反应较差，因此进行了同种异体干细胞移植，随后进行20个周期的基于阿扎胞苷的抢先治疗复发。诊断后超过31个月，相当于SCT后25个月和氮杂胞苷的最后一个周期后4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。对应于SCT后25个月和氮杂胞苷最后一个周期后的4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。对应于SCT后25个月和氮杂胞苷最后一个周期后的4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA的鉴定的需要，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。
更新日期：2019-03-09
中文翻译：
具有新的NUP98-LEDGF重排的急性髓细胞性白血病患者的长期分子缓解。
在过去的几十年中（n = 72）已经描述了NUP98基因的多种分子重排，涉及编码不同转录因子，染色质修饰酶以及各种胞质蛋白的融合伴侣。在这里，我们报告了具有变体NUP98-LEDGF / PSIP1基因融合（N9-L10）的AML-M2患者。在该患者中，由于LEDGF外显子11的选择性剪接，对三种不同的NUP98-LEDGF融合mRNA进行了表征。靶向的高通量测序揭示了IDH1，SRSF2和WT1其他病原性突变的存在。为了改善治疗监测，开发了通过实时PCR定量NUP98-LEDGF mRNA的方法。由于对常规化学疗法的反应较差，因此进行了同种异体干细胞移植，随后进行20个周期的基于阿扎胞苷的抢先治疗复发。诊断后超过31个月，相当于SCT后25个月和氮杂胞苷的最后一个周期后4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。对应于SCT后25个月和氮杂胞苷最后一个周期后的4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。对应于SCT后25个月和氮杂胞苷最后一个周期后的4个月，患者处于完全分子缓解状态（无法检测到NUP98-LEDGF mRNA转录本）。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA的鉴定的需要，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。这项研究突显了NUP98和LEDGF内断点位置的巨大差异，这与影响LEDGF的选择性剪接有关。它还强调了对两个基因中的断点进行充分表征的必要性，以及对所有融合mRNA进行鉴定的必要性，特别是对于分子监测测定法的开发而言。所有这些数据对于通常与不良预后相关的NUP98-LEDGF +血液系统恶性肿瘤的最佳治疗似乎至关重要。
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