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ProViz-一种基于Web的可视化工具,用于研究蛋白质序列的功能和进化特征。
Nucleic Acids Research ( IF 16.6 ) Pub Date : 2016 Apr 16 , DOI: 10.1093/nar/gkw265
Peter Jehl , Jean Manguy , Denis C. Shields , Desmond G. Higgins , Norman E. Davey

低通量实验以及高通量蛋白质组学和基因组分析已创建了可用于探索蛋白质功能和进化的大量数据。将这些数据整合为信息丰富且直观的格式的能力对于我们理解这些独特但互补的信息源的能力至关重要。但是,现有的可视化蛋白质相关数据的工具受到其表示,信息来源,功能或可访问性的限制。我们介绍ProViz,这是一个基于浏览器的强大工具,可通过简化蛋白质的功能和进化特征分析来帮助生物学家建立假设和设计实验。从描述蛋白质模块结构,翻译后修饰,结构,序列变异和功能区域的实验表征。这些特征被映射到来自预先计算的多个序列比对的进化信息。数据以交互式且信息丰富但直观的可视化方式显示,可通过简单的蛋白质搜索界面访问。这使生物信息学技能有限的用户可以快速访问与他们的研究相关的数据。可以使用用户定义的数据手动或使用REST API进一步自定义可视化。ProViz可从http://proviz.ucd.ie/获得。可通过简单的蛋白质搜索界面访问。这使生物信息学技能有限的用户可以快速访问与他们的研究相关的数据。可以使用用户定义的数据手动或使用REST API进一步自定义可视化。ProViz可从http://proviz.ucd.ie/获得。可通过简单的蛋白质搜索界面访问。这使生物信息学技能有限的用户可以快速访问与他们的研究相关的数据。可以使用用户定义的数据手动或使用REST API进一步自定义可视化。ProViz可从http://proviz.ucd.ie/获得。



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更新日期:2017-01-31
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