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膜蛋白小窝蛋白配体的体外进化
Journal of the American Chemical Society ( IF 14.4 ) Pub Date : 2011-06-29 , DOI: 10.1021/ja201792q
Sudipta Majumdar 1 , Agnes Hajduczki , Rosemarie Vithayathil , Tivoli J Olsen , Ryan M Spitler , Aaron S Mendez , Travis D Thompson , Gregory A Weiss
Journal of the American Chemical Society ( IF 14.4 ) Pub Date : 2011-06-29 , DOI: 10.1021/ja201792q
Sudipta Majumdar 1 , Agnes Hajduczki , Rosemarie Vithayathil , Tivoli J Olsen , Ryan M Spitler , Aaron S Mendez , Travis D Thompson , Gregory A Weiss
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膜蛋白占人类基因组的三分之一，但仍是反向化学遗传学具有挑战性的目标。例如，尽管膜蛋白caveolin-1 与包括多发性骨髓瘤在内的多种疾病有关，但由于其大部分未知的结构和不溶性，似乎无法为合成配体的发现提供一个糟糕的目标。为了打破这种僵局并确定控制先导化合物的新类型的小窝症，我们应用基于噬菌体的反向化学遗传学来发现来自抗 HIV 治疗剂 T20 的小窝蛋白 1 配体。将同源残基替换到 T20 序列中使用类似于药物化学的过程，用于亲和力成熟以结合小窝蛋白。所得的caveolin-1 配体以比野生型T20 高1000 倍以上的亲和力结合。两种类型的 ELISA 和等温滴定量热法 (ITC) 测量表明，T20 变体与 K(d) 值在 150 nM 范围内具有高亲和力绑定到小窝蛋白。具有最高亲和力的小窝蛋白配体的显微镜实验证实了配体与内源性小窝蛋白在 NIH 3T3 细胞中的共定位。结果为靶向活细胞中的小窝和小窝形成奠定了基础。
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更新日期：2011-06-29
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