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DNA和胶原蛋白之间的平行度-比较双螺旋和三螺旋的弹性模型。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2017-Oct-16 , DOI: 10.1038/s41598-017-12878-3 Fei Xu , Hongning Zheng , Nicolas Clauvelin , Xiang-Jun Lu , Wilma K. Olson , Vikas Nanda
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2017-Oct-16 , DOI: 10.1038/s41598-017-12878-3 Fei Xu , Hongning Zheng , Nicolas Clauvelin , Xiang-Jun Lu , Wilma K. Olson , Vikas Nanda
多股螺旋在自然界很普遍。很少讨论聚合物性能与生物学功能的相互作用。这项研究探讨了胶原蛋白和DNA的结构和机械特性之间的类比。我们用三螺旋梯中相邻横档的欧拉旋转和平移参数对胶原进行建模,并通过从原子分辨率结构的数据库中提取参数的离散度来开发统计潜力。所得的弹性模型提供了一种通用的定量方法来描述与整联蛋白或基质金属蛋白酶相互作用时胶原蛋白变形以及蛋白质结合后DNA变形的情况。在更大的规模上,I型胶原蛋白的变形以与高阶纤维组件的D周期带一致的周期性变化。
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更新日期:2017-10-16
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