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Mitochondrial genomes of two Australian fishflies with an evolutionary timescale of Chauliodinae.
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2017-06-30 , DOI: 10.1038/s41598-017-04799-y Fan Yang 1 , Yunlan Jiang 1 , Ding Yang 1 , Xingyue Liu 1
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2017-06-30 , DOI: 10.1038/s41598-017-04799-y Fan Yang 1 , Yunlan Jiang 1 , Ding Yang 1 , Xingyue Liu 1
Affiliation
Fishflies (Corydalidae: Chauliodinae) with a total of ca. 130 extant species are one of the major groups of the holometabolous insect order Megaloptera. As a group which originated during the Mesozoic, the phylogeny and historical biogeography of fishflies are of high interest. The previous hypothesis on the evolutionary history of fishflies was based primarily on morphological data. To further test the existing phylogenetic relationships and to understand the divergence pattern of fishflies, we conducted a molecule-based study. We determined the complete mitochondrial (mt) genomes of two Australian fishfly species, Archichauliodes deceptor Kimmins, 1954 and Protochauliodes biconicus Kimmins, 1954, both members of a major subgroup of Chauliodinae with high phylogenetic significance. A phylogenomic analysis was carried out based on 13 mt protein coding genes (PCGs) and two rRNAs genes from the megalopteran species with determined mt genomes. Both maximum likelihood and Bayesian inference analyses recovered the Dysmicohermes clade as the sister group of the Archichauliodes clade + the Protochauliodes clade, which is consistent with the previous morphology-based hypothesis. The divergence time estimation suggested that the divergence among the three major subgroups of fishflies occurred during the Late Jurassic and Early Cretaceous when the supercontinent Pangaea was undergoing sequential breakup.
中文翻译:
两种澳大利亚鱼蝇的线粒体基因组,具有 Chauliodinae 的进化时间尺度。
鱼蝇(Corydalidae:Chauliodinae)共有约 100 只。现存 130 种,是全变态昆虫大翅目的主要类群之一。作为一个起源于中生代的类群,鱼蝇的系统发育和历史生物地理学引起了人们的高度关注。先前关于鱼蝇进化史的假设主要基于形态学数据。为了进一步测试现有的系统发育关系并了解鱼蝇的分化模式,我们进行了一项基于分子的研究。我们确定了两种澳大利亚鱼蝇物种的完整线粒体 (mt) 基因组,即 Archichauliodes deceptor Kimmins, 1954 和 Protochauliodes biconicus Kimmins, 1954,这两种鱼蝇都是具有高度系统发育意义的 Chauliodinae 主要亚群的成员。基于来自已确定 mt 基因组的大翅目物种的 13 个 mt 蛋白编码基因 (PCG) 和两个 rRNA 基因进行了系统发育分析。最大似然分析和贝叶斯推理分析都将Dysmicohermes进化枝恢复为Archichauliodes进化枝+Protochauliodes进化枝的姐妹群,这与之前基于形态学的假设是一致的。分歧时间估计表明,鱼蝇三个主要亚类的分歧发生在晚侏罗世和早白垩世,当时盘古大陆正经历顺序分裂。
更新日期:2017-07-01
中文翻译:
两种澳大利亚鱼蝇的线粒体基因组,具有 Chauliodinae 的进化时间尺度。
鱼蝇(Corydalidae:Chauliodinae)共有约 100 只。现存 130 种,是全变态昆虫大翅目的主要类群之一。作为一个起源于中生代的类群,鱼蝇的系统发育和历史生物地理学引起了人们的高度关注。先前关于鱼蝇进化史的假设主要基于形态学数据。为了进一步测试现有的系统发育关系并了解鱼蝇的分化模式,我们进行了一项基于分子的研究。我们确定了两种澳大利亚鱼蝇物种的完整线粒体 (mt) 基因组,即 Archichauliodes deceptor Kimmins, 1954 和 Protochauliodes biconicus Kimmins, 1954,这两种鱼蝇都是具有高度系统发育意义的 Chauliodinae 主要亚群的成员。基于来自已确定 mt 基因组的大翅目物种的 13 个 mt 蛋白编码基因 (PCG) 和两个 rRNA 基因进行了系统发育分析。最大似然分析和贝叶斯推理分析都将Dysmicohermes进化枝恢复为Archichauliodes进化枝+Protochauliodes进化枝的姐妹群,这与之前基于形态学的假设是一致的。分歧时间估计表明,鱼蝇三个主要亚类的分歧发生在晚侏罗世和早白垩世,当时盘古大陆正经历顺序分裂。