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从非小细胞肺癌患者血浆中检测循环肿瘤DNA中EGFR突变的四种领先技术的跨平台比较
Theranostics ( IF 12.4 ) Pub Date : 2017-04-02 , DOI: 10.7150/thno.16558
Ting Xu , Xiaozheng Kang , Xiaofang You , Liang Dai , Dequan Tian , Wanpu Yan , Yongbo Yang , Hongchao Xiong , Zhen Liang , Grace Q. Zhao , Shengrong Lin , Ke-Neng Chen , Guobing Xu
Theranostics ( IF 12.4 ) Pub Date : 2017-04-02 , DOI: 10.7150/thno.16558
Ting Xu , Xiaozheng Kang , Xiaofang You , Liang Dai , Dequan Tian , Wanpu Yan , Yongbo Yang , Hongchao Xiong , Zhen Liang , Grace Q. Zhao , Shengrong Lin , Ke-Neng Chen , Guobing Xu
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循环肿瘤DNA(ctDNA)的分析正在成为一种强有力的工具,可用于指导非小细胞肺癌(NSCLC)患者的靶向治疗和监测肿瘤的进展,尤其是在没有代表性组织活检的情况下。在这里,我们比较了四种领先技术平台检测NSCLC患者ctDNA中表皮生长因子受体(EGFR)突变(L858R,外显子19缺失,T790M和G719X)的能力。比较中包括两个扩增难治性突变系统(cobas-ARMS和ADx-ARMS),液滴数字聚合酶链反应(ddPCR)和下一代测序(Firefly NGS)平台。十五种表皮生长因子确定了20例NSCLC患者的突变。Firefly NGS,cobas-ARMS和ddPCR均显示出较高的灵敏度,而ADx-ARMS更适合于定性检测血浆和组织样品中等位基因频率高于1%的EGFR突变。我们观察到血浆和组织EGFR突变谱之间的高度一致性,这三个驱动突变(L858R,外显子19缺失和G719X)是复发患者中第一代EGFR-TKI治疗的已知靶标。组织与血浆EGFR之间的差异突变谱主要归因于空间和时间肿瘤异质性,由于治疗反应和耐药性引起的突变抑制(T790M)。这项研究说明了在治疗评估和耐药性检测的背景下,选择用于EGFR ctDNA分析的技术平台所面临的挑战。
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更新日期:2017-06-30

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