Congregate homeless shelters are disproportionately affected by infectious disease outbreaks. We describe enterovirus epidemiology across 23 adult and family shelters in King County, Washington, USA, during October 2019-May 2021, by using repeated cross-sectional respiratory illness and environmental surveillance and viral genome sequencing. Among 3,281 participants >3 months of age, we identified coxsackievirus A21 (CVA21) in 39 adult residents (3.0% [95% CI 1.9%-4.8%] detection) across 7 shelters during October 2019-February 2020. We identified enterovirus D68 (EV-D68) in 5 adult residents in 2 shelters during October-November 2019. Of 812 environmental samples, 1 was EV-D68-positive and 5 were CVA21-positive. Other enteroviruses detected among residents, but not in environmental samples, included coxsackievirus A6/A4 in 3 children. No enteroviruses were detected during April 2020-May 2021. Phylogenetically clustered CVA21 and EV-D68 cases occurred in some shelters. Some shelters also hosted multiple CVA21 lineages.

中文翻译：

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2019-2021 年美国华盛顿州金县无家可归者收容所柯萨奇病毒 A21 和肠道病毒 D68 的临床和基因组流行病学。


聚集的无家可归者收容所受到传染病爆发的影响尤为严重。我们通过使用重复横断面呼吸系统疾病和环境监测以及病毒基因组测序，描述了 2019 年 10 月至 2021 年 5 月期间美国华盛顿州金县 23 个成人和家庭庇护所的肠道病毒流行病学。在 3,281 名 >3 个月大的参与者中，我们在 2019 年 10 月至 2020 年 2 月期间，在 7 个避难所的 39 名成年居民 （3.0% [95% CI 1.9%-4.8%] 检出率） 中发现了柯萨奇病毒 A21 （CVA21）。我们在 2019 年 10 月至 11 月期间在 2 个收容所的 5 名成年居民中发现了肠道病毒 D68 （EV-D68）。在 812 个环境样本中，1 个为 EV-D68 阳性，5 个为 CVA21 阳性。在居民中检测到的其他肠道病毒，但在环境样本中未检测到，包括 3 名儿童的柯萨奇病毒 A6/A4。2020 年 4 月至 2021 年 5 月期间未检测到肠道病毒。系统发育聚集的 CVA21 和 EV-D68 病例发生在一些庇护所。一些庇护所还承载了多个 CVA21 谱系。