The current study was inspired by observations from exploratory analyses of an institutional cohort with chronic myelomonocytic leukemia (CMML; N = 398) that revealed no instances of blast transformation in the seven patients with plant homeodomain finger protein 6 (PHF6) mutation (PHF6^MUT). A subsequent Mayo Clinic enterprise-wide database search identified 28 more cases with PHF6^MUT. Compared with their wild-type PHF6 counterparts (PHF6^WT; N = 391), PHF6^MUT cases (N = 35) were more likely to co-express TET2 (89% vs. 45%; p < .01), RUNX1 (29% vs. 14%; p = .03), CBL (14% vs. 2%; p < .01), and U2AF1 (17% vs. 6%; p = .04) and less likely SRSF2 (23% vs. 45%; p < .01) mutation. They were also more likely to display loss of Y chromosome (LoY; 21% vs. 2%; p < .01) and platelets <100 × 10⁹/L (83% vs. 51%; p < .01). Multivariable analysis identified PHF6^MUT (HR 0.28, 95% CI 0.15–0.50) and DNMT3A^MUT (HR 5.8, 95% CI 3.3–10.5) as the strongest molecular predictors of overall survival. The same was true for blast transformation-free survival with corresponding HR (95% CI) of 0.08 (0.01–0.6) and 9.5 (3.8–23.5). At median 20 months follow-up, blast transformation was documented in none of the 33 patients with PHF6^MUT/DNMT3A^WT but in 6 (32%) of 19 with DNMT3A^MUT and 74 (20%) of 374 with PHF6^WT/DNMT3A^WT (p < .01). The specific molecular signatures sustained their significant predictive performance in the context of the CMML-specific molecular prognostic model (CPSS-mol). PHF6^MUT identifies a unique subset of patients with CMML characterized by thrombocytopenia, higher prevalence of LoY, and superior prognosis.

中文翻译：

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慢性粒单核细胞白血病中的 PHF6 突变可识别具有不同表型和良好预后的独特患者亚群


本研究的灵感来自对慢性粒单核细胞白血病 （CMML;N = 398），该研究显示 7 例植物同源域手指蛋白 6 （PHF6） 突变 （PHF6^MUT） 患者没有原始细胞转化实例。随后的妙佑医疗国际企业范围的数据库搜索确定了另外 28 例 PHF6^MUT。与野生型 PHF6 对应物 （PHF6^WT;N = 391），PHF6^MUT 病例 （N = 35） 更有可能共表达 TET2 （89% vs. 45%;p < .01）、RUNX1 （29% 对 14%;p = .03）、CBL （14% 对 2%;p < .01） 和 U2AF1 （17% 对 6%;p = .04） 和不太可能的 SRSF2 （23% vs. 45%;p < .01） 突变。他们也更有可能显示 Y 染色体丢失 （LoY;21% 对 2%;p < .01） 和血小板 <100 × 10⁹/L （83% vs. 51%;p < .01）。多变量分析确定 PHF6^MUT （HR 0.28,95% CI 0.15-0.50） 和 DNMT3A^MUT （HR 5.8,95% CI 3.3-10.5） 是总生存期的最强分子预测因子。无原始细胞转化生存率也是如此，相应的 HR （95% CI） 为 0.08 （0.01-0.6） 和 9.5 （3.8-23.5）。在中位 20 个月的随访中，33 例 PHF6^MUT/DNMT3A^WT 患者中均未记录原始细胞转化，但 19 例 DNMT3A^MUT 患者中有 6 例 （32%） 和 374 例 PHF6^WT/DNMT3A^WT 中有 74 例 （20%） （p < .01）。 在 CMML 特异性分子预后模型 （CPSS-mol） 的背景下，特异性分子特征保持了其显著的预测性能。PHF6^MUT 确定了以血小板减少症、LoY 患病率较高和预后优越为特征的 CMML 患者独特亚群。