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胸腺嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶切除5-甲酰基胞嘧啶的结构基础
Biochemistry ( IF 2.9 ) Pub Date : 2016-11-02 00:00:00 , DOI: 10.1021/acs.biochem.6b00982
Lakshmi S. Pidugu 1 , Joshua W. Flowers 2 , Christopher T. Coey 1 , Edwin Pozharski 1, 3 , Marc M. Greenberg 2 , Alexander C. Drohat 1
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胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)是一种基本切除修复酶,在表观遗传调控中具有关键功能。在主动DNA脱甲基途径中执行关键步骤的过程中,TDG去除了5-甲酰基胞嘧啶和5-羧基胞嘧啶,这是由TET(十至十一位易位)酶产生的5-甲基胞嘧啶的氧化衍生物。我们确定了结合到DNA上的TDG的晶体结构,该化合物具有5-甲酰基脱氧胞苷的不可裂解(2'-氟阿拉伯糖)类似物,该类似物翻转进入其活性位点,揭示了其如何识别和水解fC。结合先前的结构和生化发现,这些结果说明了TDG如何利用可适应的活性位点从DNA中切除各种各样的核碱基。



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更新日期:2016-11-02
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