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Peptidomimetic Analogues Act as Effective Inhibitors against SARS-CoV-2 by Blocking the Function of Cathepsin L
Journal of Medicinal Chemistry ( IF 6.8 ) Pub Date : 2024-09-18 , DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00656 Weilong Deng 1 , Xiao Hu 1 , Xiaoman Tian 1 , Yuanyuan Zhang 1 , Weijuan Shang 2 , Leike Zhang 2 , Luqing Shang 1
Journal of Medicinal Chemistry ( IF 6.8 ) Pub Date : 2024-09-18 , DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00656 Weilong Deng 1 , Xiao Hu 1 , Xiaoman Tian 1 , Yuanyuan Zhang 1 , Weijuan Shang 2 , Leike Zhang 2 , Luqing Shang 1
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Cathepsin L (CatL) is a promising antiviral drug target of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) as an important protease for cleaving the SARS-CoV-2 spike protein and enhancing viral entry to cells. We identified a tripeptide aldehyde candidate, D1–1, which exhibited inhibitory effects against SARS-CoV-2 in Vero E6 cells. The protease screening analysis and protein pull-down assays demonstrated the direct binding of D1–1 to CatL. Guided by molecular docking, we synthesized 72 analogues. Upon analyzing the structure–activity relationships of these inhibitors, the D6 series was developed. Among them, D6–3 functioned as the most potent CatL inhibitor (IC50 = 0.27 nM, EC50 = 0.26 μM). D6–3 effectively blocked the CatL function and substantially hindered the entry of the SARS-CoV-2 pseudovirus to cells. Our work presented novel compounds for targeting and inhibiting CatL, offering valuable insights into the development of SARS-CoV-2 antivirals.
中文翻译:
拟肽类似物通过阻断组织蛋白酶 L 的功能作为对抗 SARS-CoV-2 的有效抑制剂
组织蛋白酶 L (CatL) 是严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的一种有前途的抗病毒药物靶点,是裂解 SARS-CoV-2 刺突蛋白和增强病毒进入细胞的重要蛋白酶。我们确定了一种三肽醛候选物 D1-1,它在 Vero E6 细胞中表现出对 SARS-CoV-2 的抑制作用。蛋白酶筛选分析和蛋白沉降分析表明 D1-1 与 CatL 直接结合。在分子对接的指导下,我们合成了 72 个类似物。在分析这些抑制剂的构效关系后,开发了 D6 系列。其中,D6-3 是最有效的 CatL 抑制剂 (IC50 = 0.27 nM,EC50 = 0.26 μM)。D6-3 有效阻断了 CatL 功能,并严重阻碍了 SARS-CoV-2 假病毒进入细胞。我们的工作提出了靶向和抑制 CatL 的新型化合物,为 SARS-CoV-2 抗病毒药物的开发提供了有价值的见解。
更新日期:2024-09-18
中文翻译:
拟肽类似物通过阻断组织蛋白酶 L 的功能作为对抗 SARS-CoV-2 的有效抑制剂
组织蛋白酶 L (CatL) 是严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的一种有前途的抗病毒药物靶点,是裂解 SARS-CoV-2 刺突蛋白和增强病毒进入细胞的重要蛋白酶。我们确定了一种三肽醛候选物 D1-1,它在 Vero E6 细胞中表现出对 SARS-CoV-2 的抑制作用。蛋白酶筛选分析和蛋白沉降分析表明 D1-1 与 CatL 直接结合。在分子对接的指导下,我们合成了 72 个类似物。在分析这些抑制剂的构效关系后,开发了 D6 系列。其中,D6-3 是最有效的 CatL 抑制剂 (IC50 = 0.27 nM,EC50 = 0.26 μM)。D6-3 有效阻断了 CatL 功能,并严重阻碍了 SARS-CoV-2 假病毒进入细胞。我们的工作提出了靶向和抑制 CatL 的新型化合物,为 SARS-CoV-2 抗病毒药物的开发提供了有价值的见解。