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探索水稻木质素生物合成基因:进化、功能和表达
International Journal of Molecular Sciences ( IF 4.9 ) Pub Date : 2024-09-17 , DOI: 10.3390/ijms251810001 Munsif Ali Shad, Xukai Li, Muhammad Junaid Rao, Zixuan Luo, Xianlong Li, Aamir Ali, Lingqiang Wang
木质素是自然界第二丰富的维管植物生物聚合物,在机械支撑、水运输和应激反应中发挥着重要作用。本研究基于系统发育和基序组成,鉴定了水稻中90个木质素生物合成基因,它们属于PAL、C4H、4CL、HCT、C3H、CCoAOMT、CCR、F5H、COMT和CAD家族。重复事件很大程度上促进了这些基因家族的扩展,例如 PAL、CCoAOMT、CCR 和 CAD 家族,主要归因于串联和片段重复。涵盖水稻整个生命周期的 33 个组织样本的微阵列数据表明,PAL、HCT、C3H、CCoAOMT、CCR、COMT 和 CAD 基因表达相当高,而 C4H、4CL 和 F5H 表达则相当可变。木质素相关基因的一些成员(OsCCRL11、OsHCT1/2/5、OsCCoAOMT1/3/5、OsCOMT、OsC3H、OsCAD2 和 OsPAL1/6)在所有检查的组织中都有表达。木质素相关基因的表达模式可分为两大类和八个亚类,每个亚类在典型代表初生和次生细胞壁构成的组织中表现出独特的共表达。一些木质素相关基因在典型的次生细胞壁组织中强烈共表达。组合 HPLC 分析显示,五种基因型从幼年到老年生长阶段的木质素单体(H、G 和 S)含量有所增加。基于90个基因的微阵列数据,选择27个基因进行qRT-PCR基因表达分析。四个基因(OsPAL9、OsCAD8C、OsCCR8 和 OsCOMTL4)与木质素单体显着负相关。此外,在次生生长阶段,某些基因型共表达了十一个基因。 其中,6个基因(OsC3H、OsCAD2、OsCCR2、OsCOMT、OsPAL2和OsPAL8)与微阵列基因表达重叠,突出了它们在木质素生物合成中的重要性。
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