Chromothripsis (cth) is a form of genomic instability leading to massive de novo structural chromosome rearrangements in a one-time catastrophic event. It can cause cancer-promoting alterations, such as loss of sequences for tumor-suppressor genes, formation of oncogenic fusions, and oncogene amplifications. We investigated the genetic background and clinical significance of cth in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) patients. For this purpose, whole-genome copy number alterations were analyzed in 173 children with newly diagnosed T-ALL using high-density microarrays. Cth was identified in 10 T-ALL samples (5.78%). In six of them, cth occurred in a constitutional background of Nijmegen breakage syndrome (n = 5) or Li-Fraumeni syndrome (n = 1). Cth generated alterations, including deletions of CDKN2A/B (n = 4) and EZH2 (n = 4), amplifications of CDK6 (n = 2), and NUP214::ABL1 and TFG::GPR128 fusions. Cth-positive leukemias exhibited deletions involving the tumor-suppressor genes RB1 (n = 3), TP53 (n = 1) and MED12 (n = 2). Cth-positive T-ALL patients had a lower probability of 5-year overall survival (OS) [0.56 vs. 0.81; hazard ratio (HR) = 4.14 (1.42–12.02) p = 0.017] as did 5-year event-free survival [0.45 vs. 0.74; HR = 3.91 (1.52–10.08); p = 0.012]. Chromothripsis is an infrequent genomic phenomenon in pediatric T-ALL but is significantly associated with cancer-predisposing syndromes and may associate with inferior prognosis.

染色体裂网 （cth） 是一种基因组不稳定性，导致在一次性灾难性事件中发生大规模从头结构染色体重排。它会导致促癌改变，例如肿瘤抑制基因序列丢失、致癌融合的形成和致癌基因扩增。我们调查了儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病 （T-ALL） 患者 cth 的遗传背景和临床意义。为此，使用高密度微阵列分析了 173 名新诊断的 T-ALL 儿童的全基因组拷贝数改变。在 10 例 T-ALL 样本中鉴定出 Cth （5.78%）。在其中 6 项研究中，cth 发生在奈梅亨断裂综合征 （n = 5） 或 Li-Fraumeni 综合征 （n = 1） 的体质背景下。Cth 产生改变，包括 CDKN2A/B （n = 4） 和 EZH2 （n = 4） 的缺失、CDK6 （n = 2） 的扩增以及 NUP214：：ABL1 和 TFG：：GPR128 融合。Cth 阳性白血病表现出涉及肿瘤抑制基因 RB1 （n = 3） 、 TP53 （n = 1） 和 MED12 （n = 2） 的缺失。Cth 阳性 T-ALL 患者的 5 年总生存率 （OS） [0.56 vs. 0.81;风险比 （HR） = 4.14 （1.42–12.02） p = 0.017] 和 5 年无事件生存率 [0.45 vs. 0.74;心率 = 3.91 （1.52–10.08）;p = 0.012]。染色体裂是儿科 T-ALL 中一种罕见的基因组现象，但与癌症易感综合征显著相关，并且可能与预后较差有关。