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绘制人和小鼠肺纤维化中的空间分辨转录组
Nature Genetics ( IF 31.7 ) Pub Date : 2024-07-01 , DOI: 10.1038/s41588-024-01819-2
Lovisa Franzén 1, 2 , Martina Olsson Lindvall 1 , Michael Hühn 3 , Victoria Ptasinski 1 , Laura Setyo 4 , Benjamin P Keith 5 , Astrid Collin 6 , Steven Oag 6 , Thomas Volckaert 7 , Annika Borde 7 , Joakim Lundeberg 2 , Julia Lindgren 8 , Graham Belfield 8 , Sonya Jackson 9 , Anna Ollerstam 1 , Marianna Stamou 1 , Patrik L Ståhl 2 , Jorrit J Hornberg 1
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特发性肺纤维化 (IPF) 是一种进行性肺部疾病,预后不良且治疗选择有限。由于对 IPF 发病机制的了解有限和可用临床前模型的可转化性差,确定有效治疗方法的努力受阻。在这里,我们生成了人 IPF (n = 4) 和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化 (n = 6) 的空间分辨转录组图谱,以解决这些限制。我们在 IPF 肺中发现了不同的纤维化生态位,其特征是微环境中的异常肺泡上皮细胞,该微环境中以转化生长因子 β 信号转导以及预测的调节因子(如 TP53 和 APOE)为主。我们还发现 IPF 纤维化生态位中停滞的肺泡再生与急性纤维化小鼠肺中的活性组织修复之间存在明显差异。我们的研究提供了对 IPF 转录景观的深入见解,并提出肺泡再生是一种有前途的 IPF 治疗策略。

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