当前位置:
X-MOL 学术
›
Nat. Biotechnol.
›
论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
Tracking gene order provides a new perspective on intraspecific evolution in microbiotas
Nature Biotechnology ( IF 33.1 ) Pub Date : 2024-06-19 , DOI: 10.1038/s41587-024-02277-1
Nature Biotechnology ( IF 33.1 ) Pub Date : 2024-06-19 , DOI: 10.1038/s41587-024-02277-1
|
We developed SynTracker, a tool to track conspecific microbial strains using genome synteny. SynTracker is sensitive to genomic structural variation but not to single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Combining SynTracker with methods for tracking strains using SNP profiles, we were able to detect species evolving by accumulating predominantly SNPs or predominantly structural variants.
中文翻译:
追踪基因顺序为微生物群种内进化提供了新的视角
我们开发了 SynTracker,这是一种利用基因组同线性追踪同种微生物菌株的工具。 SynTracker 对基因组结构变异敏感,但对单核苷酸多态性 (SNP) 不敏感。将 SynTracker 与使用 SNP 图谱追踪菌株的方法相结合,我们能够通过主要积累 SNP 或主要结构变异来检测物种的进化。
更新日期:2024-06-19
中文翻译:
![](https://scdn.x-mol.com/jcss/images/paperTranslation.png)
追踪基因顺序为微生物群种内进化提供了新的视角
我们开发了 SynTracker,这是一种利用基因组同线性追踪同种微生物菌株的工具。 SynTracker 对基因组结构变异敏感,但对单核苷酸多态性 (SNP) 不敏感。将 SynTracker 与使用 SNP 图谱追踪菌株的方法相结合,我们能够通过主要积累 SNP 或主要结构变异来检测物种的进化。