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React-OT:化学反应中生成过渡态的最佳传输
arXiv - PHYS - Chemical Physics Pub Date : 2024-04-20 , DOI: arxiv-2404.13430 Chenru Duan, Guan-Horng Liu, Yuanqi Du, Tianrong Chen, Qiyuan Zhao, Haojun Jia, Carla P. Gomes, Evangelos A. Theodorou, Heather J. Kulik
arXiv - PHYS - Chemical Physics Pub Date : 2024-04-20 , DOI: arxiv-2404.13430 Chenru Duan, Guan-Horng Liu, Yuanqi Du, Tianrong Chen, Qiyuan Zhao, Haojun Jia, Carla P. Gomes, Evangelos A. Theodorou, Heather J. Kulik
过渡态 (TS) 是瞬态结构,对于理解反应机制和设计催化剂至关重要,但在实验中很难捕获。或者,已经开发了许多优化算法来通过计算搜索 TS。然而,这些由量子化学方法(通常是密度泛函理论)驱动的算法的成本仍然很高,这对其在构建大型反应网络以进行反应探索方面的应用提出了挑战。在这里,我们开发了 React-OT,这是一种从反应物和产物生成独特 TS 结构的最佳传输方法。 React-OT 生成高度精确的 TS 结构,中位结构均方根偏差 (RMSD) 为 0.053{\AA},中位势垒高度误差为 1.06 kcal/mol,每个反应仅需要 0.4 秒。通过在较低理论水平 GFN2-xTB 获得的大型反应数据集上预训练 React-OT,RMSD 和势垒高度误差进一步改善了约 25%。我们设想,在探索未知机制的化学反应时,React-OT 的高精度和快速推理有助于定位 TS。
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更新日期:2024-04-23
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