<br>通过分子动力学模拟探索小分子Hsp70-Bim PPI抑制剂的结合机制,Journal of Molecular Modeling

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通过分子动力学模拟探索小分子Hsp70-Bim PPI抑制剂的结合机制
Journal of Molecular Modeling ( IF 2.1 ) Pub Date : 2024-02-13 , DOI: 10.1007/s00894-024-05874-8
Xin Li ₁ , Yuying Wang ₂ , Maojun Jiang ₁ , Fangkui Yin ₁ , Hong Zhang ₁ , Linjie Yuan ₁ , Jingjing Liu ₂ , Xingyu Wang ₂ , Ziqian Wang ₁ , Zhichao Zhang ₁

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抽象的

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Hsp70-Bim 蛋白-蛋白相互作用 (PPI) 界面已被确定为慢性粒细胞白血病 (CML) 治疗的特定靶点，并且开发了特定的抑制剂以表现出体内抗白血病活性。在此，我们探索了 Hsp70-Bim 抑制剂 6-(环己硫基)-3-((2-吗啉乙基)氨基)-1-oxo-1H-phenalene-2-carbonitrile ( S1g-6 ) 与 Hsp70 的结合机制通过 MD 模拟在原子水平上进行。 Hsp70 上的 TYR-149、THR-222、ALA-223 和 GLY-224 被确定为有助于形成 Hsp70/ S1g-6复合物的四个关键残基。此外，位点突变验证表明Hsp70的TYR-149是Hsp70-Bim PPI界面中的“热点”。这些结果可能有利于设计更多抑制剂来占据 Hsp70 表面的 Bim 结合位点。