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PANoptosis 亚型预测胃癌的预后和免疫功效

Apoptosis ( IF 6.1 ) Pub Date : 2024-02-12 , DOI: 10.1007/s10495-023-01931-4
Zitao Liu 1 , Liang Sun 1 , Xingyu Peng 1 , Jinfeng Zhu 1, 2 , Changlei Wu 1 , Wenjie Zhu 1 , Chao Huang 1 , Zhengming Zhu 1
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PANoptosis 是一种由 PANoptosome 调节的炎症性程序性细胞死亡。这种全凋亡具有细胞焦亡、细胞凋亡和坏死性凋亡的关键特征,但不能用这些细胞死亡模式中的任何一种来完全解释。这种细胞死亡机制的独特性质引起了人们的极大兴趣。然而,PANoptosis 相关特征在胃癌 (GC) 中的具体作用仍不确定。根据 PANoptosome 相关基因的表达情况,将患者分为不同的 PAN 亚型。我们进行了系统分析,以研究这些亚型之间预后和肿瘤微环境(TME)的差异。此外,我们还开发了一种风险评分,称为 PANoptosis 相关风险评分 (PANS),它是由与 PANoptosis 相关的基因构建的。我们综合分析了PANS与GC预后、TME、免疫治疗疗效和化疗药物敏感性之间的相关性。此外,我们还进行了体外实验来验证角蛋白 7 ( KRT7 ) 对 GC 的影响。我们确定了两种 PAN 亚型(PANcluster A 和 B)。 PANcluster A中PANoptosome基因高表达。PANcluster A具有预后良好、抗肿瘤淋巴细胞浸润丰富、对免疫治疗敏感等特点,属于免疫炎症型。同时,我们构建的PANS可以有效预测GC的预后和免疫效果。低PANS患者预后良好,具有肿瘤突变负荷(TMB)高、微卫星不稳定性(MSI)高、肿瘤纯度低、对免疫治疗敏感等特点。此外,PANS还可以识别不同化疗药物的合适人群。 最后,我们证实KRT7在GC中高表达。敲低KRT7的表达会显着削弱GC细胞的增殖和迁移能力。基于PANoptosis特征的模型有助于识别GC的TME特征,并能有效预测GC的预后和免疫效果。此外, KRT7的实验验证结果为抗肿瘤治疗提供了理论支持。





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更新日期:2024-02-12
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