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Genomics of alphabaculovirus isolates infecting Mamestra species from North America and Eurasia
Journal of Invertebrate Pathology ( IF 3.6 ) Pub Date : 2024-01-28 , DOI: 10.1016/j.jip.2024.108063 Martin Erlandson 1 , Doug Baldwin 1 , Just M Vlak 2 , David Theilmann 3
Journal of Invertebrate Pathology ( IF 3.6 ) Pub Date : 2024-01-28 , DOI: 10.1016/j.jip.2024.108063 Martin Erlandson 1 , Doug Baldwin 1 , Just M Vlak 2 , David Theilmann 3
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Whole genome sequencing and multiplex PCR analysis were used to characterize previously isolated baculovirus isolates from Mamestra populations in Eurasia. Although these viruses have been previously described as Mamestra brassicae nucleopolyhedrovirus (MbNPV/MabrNPV), we demonstrate here that these isolates represent strains of the baculovirus species Alphabaculovirus maconfiguratae (MacoNPV-A) and Alphabaculovirus altermaconfiguratae (MacoNPV-B ). The MabrNPV-Bu and –Uk isolates had 96% nucleotide (nt) identity to the type isolate MacoNPV-A 90/2 at the whole genome level and in addition contained a lef-7 homologue which is found in MacoNPV-A but not MacoNPV-B. MabrNPV-Si, -De and –Nl had 96.6, 96.6 and 98.5% nt identity to the type isolate MacoNPV-B 96/2 at the whole genome level, respectively and contained a helicase-2 homologue. Gene content, synteny and K-2-P lef-8 , lef-9 and polh analysis also confirmed the presence of both MacoNPV-A and MacoNPV-B isolates in Eurasia. Thus, both these alphabaculovirus species have wide Holarctic distributions in Mamestra host species. MacoNPV-A and MacoNPV-B have wide host ranges and in addition we showed that MacoNPV-B isolates trended to higher infectivity for T. ni larvae.
中文翻译：
感染北美和欧亚大陆 Mamestra 物种的 α 杆状病毒分离株的基因组学
全基因组测序和多重 PCR 分析用于表征先前从欧亚大陆 Mamestra 人群中分离的杆状病毒分离株。尽管这些病毒以前被描述为 Mamestra brassicae 核多角体病毒 （MbNPV/MabrNPV），但我们在这里证明这些分离株代表了杆状病毒种类 Alphabaculovirus maconfiguratae （MacoNPV-A） 和 Alphabaculovirus altermaconfiguratae （MacoNPV-B） 的菌株。MabrNPV-Bu 和 –Uk 分离株在全基因组水平上与分离株 MacoNPV-A 90/2 具有 96% 的核苷酸 （nt） 同一性，此外还包含一个 lef-7 同源物，该同源物存在于 MacoNPV-A 中，而不是 MacoNPV-B 中。MabrNPV-Si 、 -De 和 -Nl 在全基因组水平上与分离株 MacoNPV-B 96/2 的 nt 同源性分别为 96.6% 、 96.6% 和 98.5%，并包含一个解旋酶-2 同源物。基因含量、同线和 K-2-P lef-8、lef-9 和 polh 分析也证实了欧亚大陆存在 MacoNPV-A 和 MacoNPV-B 分离株。因此，这两种 α 杆状病毒物种在 Mamestra 宿主物种中都具有广泛的 Holarctic 分布。MacoNPV-A 和 MacoNPV-B 具有广泛的宿主范围，此外，我们发现 MacoNPV-B 分离株对 T. ni 幼虫具有更高的感染性。
更新日期：2024-01-28
中文翻译：
感染北美和欧亚大陆 Mamestra 物种的 α 杆状病毒分离株的基因组学
全基因组测序和多重 PCR 分析用于表征先前从欧亚大陆 Mamestra 人群中分离的杆状病毒分离株。尽管这些病毒以前被描述为 Mamestra brassicae 核多角体病毒 （MbNPV/MabrNPV），但我们在这里证明这些分离株代表了杆状病毒种类 Alphabaculovirus maconfiguratae （MacoNPV-A） 和 Alphabaculovirus altermaconfiguratae （MacoNPV-B） 的菌株。MabrNPV-Bu 和 –Uk 分离株在全基因组水平上与分离株 MacoNPV-A 90/2 具有 96% 的核苷酸 （nt） 同一性，此外还包含一个 lef-7 同源物，该同源物存在于 MacoNPV-A 中，而不是 MacoNPV-B 中。MabrNPV-Si 、 -De 和 -Nl 在全基因组水平上与分离株 MacoNPV-B 96/2 的 nt 同源性分别为 96.6% 、 96.6% 和 98.5%，并包含一个解旋酶-2 同源物。基因含量、同线和 K-2-P lef-8、lef-9 和 polh 分析也证实了欧亚大陆存在 MacoNPV-A 和 MacoNPV-B 分离株。因此，这两种 α 杆状病毒物种在 Mamestra 宿主物种中都具有广泛的 Holarctic 分布。MacoNPV-A 和 MacoNPV-B 具有广泛的宿主范围，此外，我们发现 MacoNPV-B 分离株对 T. ni 幼虫具有更高的感染性。
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