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立碗藓和被孢霉内生菌之间的多层次分析探讨了陆地植物和真菌之间潜在的长期相互作用
The Plant Journal ( IF 6.2 ) Pub Date : 2024-01-24 , DOI: 10.1111/tpj.16605 Davis Mathieu 1, 2 , Abigail E Bryson 1, 2 , Britta Hamberger 2 , Vasanth Singan 3 , Keykhosrow Keymanesh 3 , Mei Wang 3 , Kerrie Barry 3 , Stephen Mondo 3, 4, 5 , Jasmyn Pangilinan 3 , Maxim Koriabine 3 , Igor V Grigoriev 3, 6 , Gregory Bonito 1, 7 , Björn Hamberger 1, 2
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模式苔藓物种小立碗藓(Physcomitrium patens)长期以来一直被用于研究从苔藓植物到被子植物的陆地植物的分化。除了系统发育关系之外,有限数量的差异组织以及与最早的有胚植物相似的形态提供了一个代表基本植物结构的系统。根据当今植物与真菌的相互作用,推测这些王国之间存在着长期的关系,早于植物陆化化。被孢霉科的起源不同于其他陆地真菌,与苔藓植物的分化相似,与丛枝菌根真菌有关,但它们是自由生活的,观察到与植物相互作用,并且可以在全球苔藓微生物组中找到。由于它们的平行起源,我们在这里评估两种被孢霉科物种, Linnemannia elongata和Benniella erionia ,如何与共培养中的P. patens相互作用。我们还评估了这些真菌的Mollicute相关或Burkholderia相关的细菌内共生体(MRE 或 BRE)如何影响植物反应。通过高通量表型组学、显微镜检查、RNA 测序、差异表达分析、基因本体富集以及 99 个其他P. patens转录组研究之间的比较来研究共培养相互作用。在这里,我们提出了新的高通量方法来测量P. patens生长,识别传统琼脂培养基上未表达的 800 多个基因的新表达,识别P. patens和被孢霉科之间的微妙相互作用,并观察植物-真菌相互作用依赖的变化是否存在 MRE 或 BRE。 我们的研究根据今天观察到的植物和真菌伙伴之间的通讯,以及将L. elongata和B. erionia鉴定为与P. patens一起的现代真菌内生菌,提供了对植物和真菌伙伴如何相互作用的见解。
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