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研究凡纳滨对虾 Ecytonucleospora hepatopenaei (EHP) 两个阶段的转录组差异
Journal of Invertebrate Pathology ( IF 3.6 ) Pub Date : 2024-01-19 , DOI: 10.1016/j.jip.2024.108061 Sheng Zhang 1 , Leiting Zhang 2 , Tingyue Liu 3 , Yi Qiao 4 , Xiaohui Cao 4 , Jie Cheng 4 , Hailong Wu 5 , Hui Shen 6
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这项研究探讨了（EHP）两个不同阶段的转录组差异，这是虾健康管理的一个重要方面。我们采用高通量测序将样品分为两个阶段，“A 相”和“B 相”，根据 PTP2 和 TPS1 基因的差异表达进行定义。我们的分析确定了 2057 个基因，其中 78 个表现出显着差异，其中 62 个上调基因和 16 个下调基因。通过 GO 和 KEGG 途径进行的富集分析强调了这些基因在细胞代谢、信号转导和免疫反应中的作用。值得注意的是，IQGAP2、Rhob、Pim1 和 PCM1 等基因在 EHP 的感染过程和生命周期中具有潜在的关键作用。我们假设这些基因可能影响海藻糖代谢和葡萄糖供应，从而影响 EHP 在不同阶段的生物活性。有趣的是，“A 相”EHP 中转录本计数较低表明生物活性减少，可能正在为宿主细胞入侵做准备。这项研究提供了对 EHP 感染机制的基础了解，为未来的研究和治疗干预提供了重要的见解。
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