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Cellular targets and lysine selectivity of the HERC5 ISG15 ligase
iScience ( IF 4.6 ) Pub Date : 2024-01-09 , DOI: 10.1016/j.isci.2024.108820
Xu Zhao 1 , Jessica M Perez 1 , Peter A Faull 2 , Catherine Chan 1 , Femke W Munting 1 , Larissa A Canadeo 1 , Can Cenik 1 , Jon M Huibregtse 1, 3
iScience ( IF 4.6 ) Pub Date : 2024-01-09 , DOI: 10.1016/j.isci.2024.108820
Xu Zhao 1 , Jessica M Perez 1 , Peter A Faull 2 , Catherine Chan 1 , Femke W Munting 1 , Larissa A Canadeo 1 , Can Cenik 1 , Jon M Huibregtse 1, 3
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ISG15 is a type I interferon-induced ubiquitin-like modifier that functions in innate immune responses. The major human ISG15 ligase is hHERC5, a ribosome-associated HECT E3 that broadly ISGylates proteins cotranslationally. Here, we characterized the hHERC5-dependent ISGylome and identified over 2,000 modified lysines in over 1,100 proteins in IFN-β-stimulated cells. In parallel, we compared the substrate selectivity hHERC5 to the major mouse ISG15 ligase, mHERC6, and analysis of sequences surrounding ISGylation sites revealed that hHERC5 and mHERC6 have distinct preferences for amino acid sequence context. Several features of the datasets were consistent with ISGylation of ribosome-tethered nascent chains, and mHERC6, like hHERC5, cotranslationally modified nascent polypeptides. The ISGylome datasets presented here represent the largest numbers of protein targets and modification sites attributable to a single Ub/Ubl ligase and the lysine selectivities of the hHERC5 and mHERC6 enzymes may have implications for the activities of HECT domain ligases, generally.
中文翻译：
HERC5 ISG15 连接酶的细胞靶标和赖氨酸选择性
ISG15 是一种 I 型干扰素诱导的泛素样修饰剂，在先天免疫反应中发挥作用。主要的人 ISG15 连接酶是 hHERC5，这是一种核糖体相关的 HECT E3，可广泛地 ISGyl化蛋白质共翻译。在这里，我们表征了 hHERC5 依赖性 ISGylome，并在 IFN β刺激的细胞中的 1,100 多种蛋白质中鉴定了 2,000 多种修饰的赖氨酸。同时，我们将底物选择性 hHERC5 与主要小鼠 ISG15 连接酶 mHERC6 进行了比较，并对 ISGylation 位点周围的序列进行了分析，发现 hHERC5 和 mHERC6 对氨基酸序列环境具有不同的偏好。数据集的几个特征与核糖体栓系新生链的 ISGylation 和 mHERC6 （如 hHERC5）共翻译修饰的新生多肽一致。此处介绍的 ISGylome 数据集代表了可归因于单个 Ub/Ubl 连接酶的最大数量的蛋白质靶标和修饰位点，并且 hHERC5 和 mHERC6 酶的赖氨酸选择性通常可能对 HECT 结构域连接酶的活性产生影响。
更新日期：2024-01-09
中文翻译：
HERC5 ISG15 连接酶的细胞靶标和赖氨酸选择性
ISG15 是一种 I 型干扰素诱导的泛素样修饰剂，在先天免疫反应中发挥作用。主要的人 ISG15 连接酶是 hHERC5，这是一种核糖体相关的 HECT E3，可广泛地 ISGyl化蛋白质共翻译。在这里，我们表征了 hHERC5 依赖性 ISGylome，并在 IFN β刺激的细胞中的 1,100 多种蛋白质中鉴定了 2,000 多种修饰的赖氨酸。同时，我们将底物选择性 hHERC5 与主要小鼠 ISG15 连接酶 mHERC6 进行了比较，并对 ISGylation 位点周围的序列进行了分析，发现 hHERC5 和 mHERC6 对氨基酸序列环境具有不同的偏好。数据集的几个特征与核糖体栓系新生链的 ISGylation 和 mHERC6 （如 hHERC5）共翻译修饰的新生多肽一致。此处介绍的 ISGylome 数据集代表了可归因于单个 Ub/Ubl 连接酶的最大数量的蛋白质靶标和修饰位点，并且 hHERC5 和 mHERC6 酶的赖氨酸选择性通常可能对 HECT 结构域连接酶的活性产生影响。
京公网安备 11010802027423号