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探针 DNA 定向固定在 swCNT-FET 上以增强 EcoRV 检测的灵敏度
Nano Letters ( IF 9.6 ) Pub Date : 2023-12-26 , DOI: 10.1021/acs.nanolett.3c03877 Hyunju Cho 1 , Da Eun Oh 1 , Sébastien Côté 2, 3 , Chang-Seuk Lee 4 , Tae Hyun Kim 1
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我们提出了一种新方法，将电测量与分子动力学 (MD) 模拟相结合，以评估 II 型限制性内切酶（特别是 EcoRV）的活性。我们的方法采用单壁碳纳米管场效应晶体管 (swCNT-FET)，该晶体管通过 EcoRV 底物 DNA 进行功能化，从而能够检测酶促裂解事件。值得注意的是，我们利用亚甲蓝（MB）标签作为“方向引导”，将 EcoRV 底物 DNA 固定在特定方向，从而增强 DNA 裂解反应与 swCNT 表面的接近度，从而提高 EcoRV 检测的灵敏度。我们进行了计算建模，以比较带有 MB 标签的 DNA 与不含 MB 的 DNA 的构象和静电势 (ESP)，为我们的电学测量提供了强有力的支持。构象模拟和 ESP 模拟都与我们的实验数据表现出强烈的一致性。还评估了 EcoRV 抑制剂金三羧酸 (ATA) 的抑制功效，并检查了传感装置的选择性。
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