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使用 Pteria penguin 基因组追踪后生动物中金属蛋白酶组织抑制剂的进化
iScience ( IF 4.6 ) Pub Date : 2023-11-25 , DOI: 10.1016/j.isci.2023.108579 Chao-Yi Ma 1, 2 , Yi Chen 3, 4 , Xin Zhan 3, 4 , Yun-Wei Dong 1, 2
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金属蛋白酶组织抑制剂 (TIMP) 在调节细胞外基质 (ECM) 动力学中起着关键作用,并已在脊椎动物中得到广泛研究。然而,了解它们在无脊椎动物门中的进化是有限的。利用高质量的基因组,我们对后生动物进行了系统发育正序分析,揭示了 TIMP 基因家族的出现和分布。我们的研究结果表明,TIMP 库起源于真后生动物辐射期间,在不同的分支中经历独立的重复事件,导致不同的家庭规模。特别是,软体动物中的双壳类翼形目表现出最显着的扩张,并在后生动物中表现出最多样化的 TIMP 库。这些扩增归因于多个基因复制事件,可能是由与多个适应性状相关的功能多样化需求驱动的,有助于翼形双壳类适应为固定滤食性动物。在这种情况下,翼形双壳类为研究无脊椎动物 TIMP 进化提供了一个有前途的模型。
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