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癌细胞对热休克诱导刺激的转录反应涉及 HSF1 结合的增强
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-11-16 , DOI: 10.1038/s41467-023-43157-7
Sayantani Ghosh Dastidar 1, 2 , Bony De Kumar 1, 3 , Bo Lauckner 1 , Damien Parrello 1 , Danielle Perley 1, 4 , Maria Vlasenok 1, 5 , Antariksh Tyagi 1, 3 , Nii Koney-Kwaku Koney 1, 6 , Ata Abbas 1, 7 , Sergei Nechaev 1
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人们越来越多地发现细胞对刺激的反应涉及已知靶基因之外的序列特异性转录因子的结合。我们想要确定转录因子的全基因组结合和功能在多大程度上是由细胞类型与刺激决定的。为此,我们用两种不同的刺激在两种不同的癌细胞系中诱导了热休克反应途径,并将其主调节因子 HSF1 与新生 RNA 和染色质可及性的结合相关联。在这里,我们表明 HSF1 结合模式在基础条件和不同激活强度下保持其同一性,因此常见的 HSF1 结合与不同的转录结果全局相关。 HSF1 诱导的 DNA 可及性增加规模不大,但主要发生在远程基因组位点。除了在包括启动子和增强子在内的现有元件上调节转录之外,在对刺激的反应过程中放大的HSF1结合可能会与非活性染色质结合。

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