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动态反离子凝聚模型解码 SARS-CoV-2 中 RNA 假结的功能动力学：离子介导的刺穿套索拓扑的控制
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2023-11-13 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02755
Avijit Mainan 1 , Susmita Roy 1
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2023-11-13 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02755
Avijit Mainan 1 , Susmita Roy 1
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程序化移码刺激元件是治疗 COVID-19 的一个有前景的药物靶标，涉及 RNA 假结 (PK) 结构。这种 RNA PK 促进移码，使 RNA 病毒能够从单个 mRNA 翻译多种蛋白质，这是它们快速进化的关键策略。该研究克服了在动态抗衡离子环境（K +和 Mg 2+ ）影响下捕获 RNA 大规模结构变化的挑战，扩展了新开发的动态抗衡离子凝聚（DCC）模型的应用。DCC 模拟揭示了这种 RNA PK 的潜在折叠途径，并得到使用光镊获得的实验结果的支持。该研究阐明了 Mg 2+离子在构建类似套索的 RNA 拓扑中的关键作用，这是一种控制 RNA 开环和闭环状态之间动态转换的新型 RNA 基序。由 Mg 2+介导的相互作用引导的刺穿套索组件协调向内和向外运动微调滑段上的张力，这是优化移码效率的关键因素。
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更新日期：2023-11-13
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