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高度解析的基因组作为研究具有不同宿主特异性的两个密切相关的虱子谱系的物种形成历史的工具。
bioRxiv - Genomics Pub Date : 2023-11-05 , DOI: 10.1101/2023.11.03.565481
Jana Martinů , Hassan Tarabai , Jan Štefka , Václav Hypša
bioRxiv - Genomics Pub Date : 2023-11-05 , DOI: 10.1101/2023.11.03.565481
Jana Martinů , Hassan Tarabai , Jan Štefka , Václav Hypša
吸虱亚目吸虱是永久性体外寄生虫,具有特定的生活方式和高度衍生的特征。目前,基因组数据仅适用于单一物种,即人类虱子。在这项研究中,我们展示了啮齿动物虱子Polyplax serrata的两个不同谱系、不同宿主谱的基因组。这些生态上不同谱系的基因组在基因内容上非常相似,表现出高水平的同线性,但它们也因很少的易位和单一倒位而有所不同。与P. humanus相比,两个P. serrata基因组明显更大(139 Mbp vs. 111 Mbp)并且编码更多数量的基因。与P. humanus类似,它们在视觉和嗅觉等感官相关类别中显着减少。利用全基因组基因组,我们对P. serrata谱系进行系统发育重建和进化测年。获得的估计揭示了它们相对较深的起源(约 6.5 Mya),与人类和黑猩猩虱子(Pediculus humanus和P. schaeffi)之间的分裂时间相当。这一测年结果支持了这样的观点,即锯缘齿蜥谱系很可能代表两种具有不同寄主光谱的隐秘物种。这两个谱系的历史人口统计显示与冰川相关的种群规模(Ne)减少,但最近仅在宿主特异性较低的谱系中看到 Ne 的恢复。我们与虱子基因组一起分析了其细菌共生体军团菌的基因组,并评估了它们在氨基酸和 B 族维生素合成方面的潜在互补性。我们发现,Polyplax / Legionella和Pediculus / Riesia这两个系统表现出几乎相同的模式,共生体参与 B 族维生素的合成,但不参与氨基酸的合成。
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更新日期:2023-11-06

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