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DNMT 和 HDAC 抑制诱导人内源性逆转录病毒元件衍生转录物产生免疫原性新抗原
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-10-23 , DOI: 10.1038/s41467-023-42417-w Ashish Goyal 1 , Jens Bauer 2, 3, 4 , Joschka Hey 1, 5, 6 , Dimitris N Papageorgiou 7, 8 , Ekaterina Stepanova 9 , Michael Daskalakis 1, 10 , Jonas Scheid 2, 3, 4, 11 , Marissa Dubbelaar 2, 3, 4, 11 , Boris Klimovich 4, 12 , Dominic Schwarz 7 , Melanie Märklin 4, 12 , Malte Roerden 2, 4 , Yu-Yu Lin 1 , Tobias Ma 13 , Oliver Mücke 1 , Hans-Georg Rammensee 3, 4, 14 , Michael Lübbert 13 , Fabricio Loayza-Puch 9 , Jeroen Krijgsveld 7, 8 , Juliane S Walz 2, 3, 4, 12 , Christoph Plass 1, 6, 14
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更新日期:2023-10-24
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-10-23 , DOI: 10.1038/s41467-023-42417-w Ashish Goyal 1 , Jens Bauer 2, 3, 4 , Joschka Hey 1, 5, 6 , Dimitris N Papageorgiou 7, 8 , Ekaterina Stepanova 9 , Michael Daskalakis 1, 10 , Jonas Scheid 2, 3, 4, 11 , Marissa Dubbelaar 2, 3, 4, 11 , Boris Klimovich 4, 12 , Dominic Schwarz 7 , Melanie Märklin 4, 12 , Malte Roerden 2, 4 , Yu-Yu Lin 1 , Tobias Ma 13 , Oliver Mücke 1 , Hans-Georg Rammensee 3, 4, 14 , Michael Lübbert 13 , Fabricio Loayza-Puch 9 , Jeroen Krijgsveld 7, 8 , Juliane S Walz 2, 3, 4, 12 , Christoph Plass 1, 6, 14
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针对癌症特异性新抗原的免疫疗法彻底改变了癌症患者的治疗。最近的证据表明,表观遗传疗法与免疫疗法具有协同作用,通过内源性逆转录病毒元件(ERV)编码启动子的去抑制和转录的启动介导。在这里,我们使用来自经 DNA 甲基转移酶抑制剂 (DNMTi) 和/或组蛋白脱乙酰酶抑制剂 (HDACi) 处理的癌细胞系的深度 RNA 测序来组装从头转录组,并鉴定数千个源自 ERV 的、治疗诱导的新型聚腺苷酸化转录本。锡帕特)。使用免疫肽组学,我们证明了 45 种经过光谱验证的治疗诱导的 TINPAT 产生的新肽(t-新肽)的人类白细胞抗原 (HLA) 呈递。我们阐述了已鉴定的 t 新肽引发 T 细胞反应以有效靶向癌细胞的潜力。我们进一步验证了用 DNMT 抑制剂地西他滨进行体内治疗后 AML 患者样本中是否存在 t-新肽。我们的研究结果强调了 ERV 衍生的新抗原在表观遗传和免疫治疗中的潜力。
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