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非生物胁迫下芦笋(Asparagus officinalis)播种期热激转录因子(Hsf)成员的全基因组鉴定与综合分析
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2023-10-23 , DOI: 10.1038/s41598-023-45322-w
Caihua Li 1 , Yuhuan Li 1 , Zeng Zhou 2 , Yudi Huang 2 , Zunzun Tu 2 , Xin Zhuo 2 , Dingyuan Tian 2 , Yibo Liu 2 , Hongli Di 2 , Ze Lin 2 , Mingxin Shi 2 , Xue He 2 , Haiyu Xu 1 , Yi Zheng 1 , Zhongsheng Mu 1
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热休克转录因子(Hsf)作为必需转录因子至关重要。它们作为受热应激调节的基因的直接转录激活剂,并与各种非生物应激密切相关。芦笋(Asparagus officinalis)是一种具有重要经济和营养意义的蔬菜,富含必需维生素、矿物质和膳食纤维。然而,芦笋对环境胁迫敏感,特定的非生物胁迫会损害其产量和质量。在此背景下,通过参考基因组识别了Hsf成员,并对物理和化学属性、进化方面、基序、基因结构、顺式作用元件、共线性和非生物胁迫下的表达模式进行了综合分析。调查结果确定了 18 名成员,分为 5 个不同的亚组。每个亚组内的成员表现出类似的基序、基因结构和顺作用元件。共线性分析揭示了一个值得注意的模式,揭示芦笋中的 Hsf 成员分别与拟南芥、水稻和大豆中的对应物共享一对、两对和三对。此外,成员在幼苗阶段表现出组织特异性表达,根部成为可行的靶组织。值得注意的是,某些成员的表达水平在非生物胁迫的影响下发生了改变。这项研究为了解 Hsf 成员建立了一个基础框架,并为分子育种在芦笋栽培中的潜在应用提供了宝贵的见解。





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更新日期:2023-10-23
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