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P450Rdb：手动管理的细胞色素 P450 酶催化反应数据库
Journal of Advanced Research ( IF 11.4 ) Pub Date : 2023-10-21 , DOI: 10.1016/j.jare.2023.10.012
Yang Zhang 1 , Xianrun Pan 2 , Tianyu Shi 3 , Zhifeng Gu 3 , Zhaochang Yang 3 , Minghao Liu 3 , Yi Xu 3 , Yu Yang 4 , Liping Ren 4 , Xiaoming Song 5 , Hao Lin 3 , Kejun Deng 3
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细胞色素 P450 酶 (P450) 被认为是全球用途最广泛的催化剂，在所有生命领域的众多生物代谢和生物合成过程中发挥着至关重要的作用。尽管数据库中有大量 P450 基因（超过 300,000 个），但只有一小部分（不到 0.2%）进行了功能表征。为了提供一个方便的平台，提供有关 P450 及其相应反应的丰富信息，我们引入了 P450Rdb 数据库，这是一个手动策划的资源，编译了由 P450 催化的文献支持的反应。所有 P450 和反应都是根据文献和已知数据库手动策划的。随后，P450反应根据其化学反应类型和位点进行组织和分类。该网站采用HTML和PHP语言开发，采用MySQL服务器进行数据存储。当前版本的 P450Rdb 记录了 1,600 多个反应，涉及 200 多个物种的 590 多个 P450。此外，它还提供了一个用户友好的界面，信息全面，可以轻松查询、浏览和分析 P450 及其相应的反应。 P450Rdb 可在 上免费获得。我们相信，该数据库将显着促进P450的结构和功能研究，从而促进天然产物合成、制药工程、生物技术应用、农业和作物改良以及化学工业等领域的进步。
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