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使用 1HN 和 1Hα 检测的 NMR 测量来分配肿瘤抑制因子 p53 蛋白的无序、富含脯氨酸的 N 端结构域
Biomolecular NMR Assignments ( IF 0.8 ) Pub Date : 2023-10-20 , DOI: 10.1007/s12104-023-10160-4
Fanni Sebák 1 , Péter Ecsédi 2 , László Nyitray 2 , Andrea Bodor 1
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p53 蛋白因在肿瘤抑制中发挥关键作用而闻名,p53 基因突变是伴随致癌转化的最常见基因组事件之一。人们不断研究针对癌症治疗的无序蛋白质/蛋白质区域,为此原子水平信息也是必要的。 p53 无序的 N 端部分包含反式激活和富含脯氨酸的结构域(除了富含脯氨酸残基之外)还包含重复的 Pro-Ala 基序。由于1 H N检测方法中缺乏酰胺质子,并且化学位移色散较小,对此类重复的富含脯氨酸的区域进行 NMR 分配具有挑战性。在本研究中,我们通过应用1 H N1 H α检测 NMR 实验的组合来执行 p53 1-100区域的完整分配。我们还展示了使用实时同核和异核解耦采集方案时增加的信息内容。另一方面,我们强调了少量脯氨酸种类的存在,并使用前选择性实验确定了相应的顺式反式构象。 (C α –C β ) 原子的二次化学位移表明该区域的无序性质,TAD1 区域具有预期的螺旋趋势。由于富含脯氨酸结构域的作用尚未得到充分了解,我们的结果可以有助于进一步成功的研究。





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更新日期:2023-10-20
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