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人类端粒 G-四链体 DNA 折叠机制的计算探测
Journal of Chemical Information and Modeling ( IF 5.6 ) Pub Date : 2023-10-02 , DOI: 10.1021/acs.jcim.3c01257
Hyeonjun Kim 1 , Eunae Kim 2 , Youngshang Pak 1
Journal of Chemical Information and Modeling ( IF 5.6 ) Pub Date : 2023-10-02 , DOI: 10.1021/acs.jcim.3c01257
Hyeonjun Kim 1 , Eunae Kim 2 , Youngshang Pak 1
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人类端粒末端区域的人类端粒 (htel) 序列形成不同的 G-四链体 (GQ) 结构。尽管进行了大量的实验努力来阐明 htel GQ 的折叠途径，但尚未提出 htel GQ 折叠的综合模型。在这里，我们描述了通过最先进的全原子水平增强采样分子动力学模拟确定的 htel GQ 折叠路径。简而言之，GQ 折叠是通过形成单发夹开始的，然后形成双发夹，然后通过不同的折叠路径分支产生不同的 GQ 拓扑（反平行椅、反平行篮、混合体 1 和 2 以及平行螺旋桨）。除了这些双发夹态之外，反平行主链排列中的三三联体和二四联体结构也是连接两个不同 GQ 之间的 GQ 折叠和过渡的关键中间体。
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更新日期：2023-10-02
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