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育亨宾与天然聚合 DNA 结合特性的机制研究
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2023-09-19 , DOI: 10.1038/s41598-023-40713-5 Soching Luikham 1 , Senchumbeni Yanthan 1 , Jhimli Bhattacharyya 1
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更新日期:2023-09-21
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2023-09-19 , DOI: 10.1038/s41598-023-40713-5 Soching Luikham 1 , Senchumbeni Yanthan 1 , Jhimli Bhattacharyya 1
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DNA 与多价配体的相互作用已日益成为大量研究的主题。对于几种具有治疗潜力的小分子,核酸是它们的主要分子靶标。这种相互作用已被证明会影响转录或复制,最终导致细胞凋亡。因此,研究人员越来越有兴趣了解小分子如何与 DNA 相互作用,从而使开发新的 DNA 特异性药物成为可能。具有生物活性的吲哚生物碱育亨宾(Yohimbine;Yh)的药理学特性已被广泛研究,但其与 DNA 的结合模式迄今尚未阐明。本研究采用分子建模和多光谱方法来研究育亨宾和鲱鱼睾丸(HT DNA)在生理条件下的相互作用。观察到荧光强度的轻微低色和红色变化,表明 Yh 与 HT DNA 结合。使用McGhee-von Hipple方法的Scatchard图分析揭示了10 5 M -1范围内的非合作结合和亲和力。热力学参数表明放热结合,这受到温度依赖性荧光实验的负焓和正熵变化的支持。盐依赖性荧光表明配体和 DNA 之间的相互作用受非聚电解力控制。碘化物猝灭、尿素变性测定、染料置换和计算机分子对接的结果表明 Yh 与 HT DNA 的凹槽结合。因此,相互作用的凹槽结合机制通过生物物理和计算技术得到了验证。Yh 与天然存在的聚合 DNA 相互作用的结构阐明和能量分析对于 DNA 靶向疗法的开发可能有用。
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