东方粘虫粘虫染色体水平基因组组装,Scientific Data

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东方粘虫粘虫染色体水平基因组组装
Scientific Data ( IF 5.8 ) Pub Date : 2023-09-08 , DOI: 10.1038/s41597-023-02506-3
Chao Xu _{1,

2} , Jichao Ji _{1,

3,

4} , Xiangzhen Zhu _{1,

3,

4} , Ningbo Huangfu _{1,

2} , Hui Xue _{1,

2} , Li Wang _{1,

3,

4} , Kaixin Zhang _{1,

3,

4} , Dongyang Li _{1,

3,

4} , Lin Niu _{1,

3,

4} , Ran Chen _{1,

5} , Xueke Gao _{1,

3,

4} , Junyu Luo _{1,

3,

4} , Jinjie Cui _{1,

3,

4}

Affiliation

东方粘虫Mythimna separata是一种破坏力极强的杂食性害虫，寄主范围广泛，严重威胁农业生产安全。在这里，使用 Illumina、PacBio HiFi 长测序和 Hi-C 支架技术组装了高质量的染色体水平基因组。基因组大小为 706.30 Mb，重叠群 N50 为 22.08 Mb，99.2% 的组装序列锚定到 31 条染色体。此外，还鉴定了 20,375 个蛋白质编码基因和 258.68 Mb 转座元件。M. separata的染色体水平基因组组装为该昆虫的未来研究提供了重要的遗传资源，并有助于管理策略的制定。

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更新日期：2023-09-08

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